治疗包皮水肿需明确水肿原因后，对症病因进行治疗。如果发生包皮感染而出现水肿，这时需口服或静脉输注抗感染药物进行治疗。因手术外伤源性导致术后水肿或伤后水肿，则多为局部血液循环不畅引起的淤滞性水肿。此时需适度给予加压包扎，促进水肿吸收减轻水肿。
一般都有个人长时间的卫生习惯不良，包皮垢反复刺激导致局部的皮脂腺腺管口堵塞有关，部分可能与先天发育异常有关。这种情况药物治疗是没有明显作用的，如果明显的影响了性功能或者是有明显临床症状，就需要手术治疗。
术后的包皮水肿是包皮手术的正常现象，是由于手术切割包皮后，破坏了原来包皮的血液循环，在新的血液循环建立起来之前，可能会出现水肿和疼痛的情况，平时要注意局部的清洁，然后及时换药。
包皮水肿可以药物治疗消除，手术后出现包皮的水肿，要注意尽量卧床休息，避免长时间站立促进淋巴血液的回流。注意保持皮肤清洁干燥，避免尿液刺激。可以局部热敷，促进血液循环利于消肿。
适宜伤口愈合的食物，缺锌会使纤维细胞功能下降，锌主要存在于木耳，海带，猪皮，猪蹄等食物中，脂类的缺乏会导致伤口愈合缺损，蛋白质，饮食中增加蛋白质能促进伤口愈合，减少感染机会，含蛋白质丰富的食物有各种瘦肉，牛奶，蛋类等。
割完包皮水肿会在一周到四周的时间消退，水肿加重，消退则相对比较慢，早期卧床休息，每天对伤口进行换药，伤口换药时应该用敷料将包皮的创面进行有效的加压包扎，则不会发生水肿。