输尿管软镜容易出现感染甚至感染性休克，手术后需要严密观察生命体征情况，如果出现心率快血压低、寒颤等情况，需要及时告知。输尿管软镜术后第二天可以下床活动，进食软食，多喝水。不能活动过多，容易引起腰痛。术后需要复查结石情况，术后一月拔出输尿管支架管。
输尿管软镜取石，需要住院进行，手术费为2500元-3000元。麻醉需要采用全身麻醉，麻醉费大约需要2000元，共计需要花费4500元-5000元。这只是麻醉和手术费，不包括住院期间的检查费及用药治疗、后期药物排石等辅助治疗的费用。
可能会导致尿路感染发烧，取石的效率不高，可能需要多次的手术，有可能会导致肾周感染，肾脏包膜下血肿等。如果肾脏结石小于2到3厘米，是可以选择做输尿管软镜取石术，如果肾结石更大，大于三厘米，可以选择其他的手术方式。
输尿管软镜取肾结石技术，单纯适用于2cm以下肾结石，发展到结合其它辅助手术设备，适用于2cm以上包括柱状结石和鹿角状结石，大致方法是提前一周置入输尿管支架管，建立手术通道。通过输尿管置入软镜鞘，输尿管软镜经软镜鞘进入肾盂，在显示屏监视下激光碎石，最后输尿管再置输尿管支架，避免输尿管狭窄。
通过尿道插入输尿管软镜进入膀胱，在膀胱中通过患侧输尿管膀胱开口部位，插入软镜到结石肾一侧的输尿管，软镜通过输尿管进入肾盂，使用钬激光对肾盂中的结石进行碎石，冲洗出粉碎的结石后退镜。
输尿管软镜取肾结石技术，单纯适用于2cm以下肾结石，适用于2cm以上包括柱状结石和鹿角状结石，大致方法如下：提前一周置入输尿管支架管，建立手术通道；通过输尿管置入软镜鞘，输尿管软镜经软镜鞘进入肾盂，在显示屏监视下激光碎石，最后输尿管再置输尿管支架，避免输尿管狭窄；术后观察结石清除率，若排出彻底，可在一月后拔出输尿管支架管，若仍有残余结石，需依据病情评估，选择合适治疗方案。