肾结石的痛苦主要有肾盂阻塞、肾盏腔内压力增加、肾包膜张力过度等，还可能与肾脏结石的炎症、水肿、黏膜刺激、蠕动增强等有关。
疼痛的主要发生在腰部和腰部。但如果肾脏体积小，则可能会在肾盂或肾盏中移动，特别是在肾盂出口处和肾盏的颈段，使其发生强烈的运动。因此如果尿道突然阻塞，会导致肾脏聚集的牵引，导致肾脏绞痛。肾结石有明显的痛楚，主要表现为一侧的腰腹部有钝痛或隐痛，运动后会加剧。在肾脏或输尿管中运动并受到刺激的小结石会导致肌肉的抽搐。
肾结石背上可能会疼。
因为结石在肾脏，肾结石从肾到输卵管的过程中，必然会导致疼痛，主要表现为腰背部疼痛，一般都是向上腹部或会阴部位辐射。这种疼痛的放射位置和结石所在的位置有关。一般结石位于上方，可引起肾脏更明显的疼痛，而在下方的结石则会向会阴部位辐射。对于结石，需要进行b超检查，确定结石的大小，位置，以及有没有导致积水，从而确定治疗的方法。
肾结石会导致痛苦，第一种是由石头引起的，主要是由于结石导致的。
输尿管是肾脏排尿的通道，容局部阻塞，可能会导致肾结石阻塞，出现明显的水肿，会导致局部的坠胀不适。当局部感觉到压力的时候，肾就会被一层薄膜包裹住，就像是一件外套，会让人的身体产生一种不舒服的感觉。肾结石和输尿管结石有很大的区别，一旦落在了输尿管里，就会有很大的痛苦。
震肾结石后可能是因为结石的影响造成疼痛。
震肾结石后有些病人可出现血尿、发烧等情况。痛是因为肾结石被震碎了，结石从肾脏排到输尿管里，输尿管受结石刺激可引起黏膜水肿所致，引起输尿管强烈的痉挛，输尿管强烈的痉挛在这里表现就是一个疼痛的过程。因此对肾结石碎石后患者来说，建议大量饮水，有效解除输尿管痉挛、促使结石迅速排出体外，能迅速缓解病症。碎石后大量饮水、服用排石药、在疼痛发作期宜给予双氯灭痛栓、肛门内用药等，能有效减轻疼痛症状，通常5分钟见效。
肾结石引起疼痛，主要是由于结石发生增大所致，或甚至出现活动轨迹，结石向狭窄处排泄，对肾盂粘膜有摩擦作用，黏膜受到刺激时，可产生疼痛，结石患者必须及时就医，若结石较少，可采取服用某些排石等措施，可降低结石发病率，促进结石排出。
一般情况下，肾结石患者都存在着尿路堵塞的问题，但是很多人并没有注意这些现象，这样很容易造成肾功能受损，所以对于这种疾病一定要加以重视，积极的预防和控制。
若结石较大，药物治疗的疗效并不特别显着，可采用手术治疗，病人可到医院进行体外超声波碎石治疗。结石患者通常应大量饮水，多饮水，能加快结石的排泄，通常必须尽量避免喝浓茶或咖啡之类的饮料，平时还应适量锻炼，例如可进行跳绳、跳高之类的运动。