胚胎停止发育，没有很好的治疗方法，只能够终止妊娠，尽早进行清宫手术，这样才会减少对妈妈身体的损伤。一般胚胎停止发育之前，要来医院做相关检查，如血常规、血型、凝血四项以及输血四项，还有心电图，必要的时候还需要查肝肾功能，做好这些术前准备以后，还需要检查白带常规，排除有阴道的感染，这样就可以准备做清宫手术。
因为停止发育的胚胎稽留在体内，会和子宫之间形成粘连，带来凝血异常、感染等问题，仅靠药物流产是流不干净的，所以一旦确诊胎停后，必须要及时进行清宫手术。术后两周内要尽量充分休息，不要从事重体力劳动和使用冷水，避免身体受寒。还要注意平时增加营养，增强机体对疾病的抵抗力，促进受损器官的早日康复。
胚胎停育应该及时的去医院做相关的检查，明确病因对症治疗。因为是有生殖内分泌原因，是黄体功能不全，多囊卵巢原因有关系的，也会有男性的精子质量。还有子宫和卵巢功能问题，子宫大小是否有异常，异常的细菌性感染或者衣原体问题。
胚胎停育的前兆主要有阴道出血、腹痛、妊娠反应逐渐停止、基础体温下降，如果处于孕中晚期，症状主要有胎动逐渐减少，没有胎动。孕期内分泌有问题也会直接影响到胚胎发育，因为受精卵着床发育成为胚胎，然后再发育成为胎儿，都需要黄体功能来维持，内分泌有问题，黄体酮分泌也会异常。
在排卵前2到3天及排卵后1天受孕流产率就低，在排卵前要减少性生活并做好孕前准备—体质、心理、环境等准备。对胎停育的预防中医中药调治很重要。不能因为西医检查正常就不予重视、理会、治疗，而发生再次胚胎停育的不良结果。所以，孕前必要的基础调治及孕后安胎养胎调理是必要的。