卵巢囊肿的原因有：生理性囊肿：如滤泡囊肿、黄体囊肿。病理性囊肿：如巧克力囊肿、浆液性囊腺瘤、黏液性囊腺瘤等。盆腔炎症引起的输卵管卵巢囊肿。对于卵巢滤泡囊肿、黄体囊肿观察即可或口服避孕药2-3个月，多数可自行消失，不用特殊治疗。对于盆腔炎症引起的输卵管卵巢囊肿，可以对症抗炎治疗，病情进一步发展，可以考虑手术治疗。对于病理性囊肿，如卵巢巧克力囊肿、浆液性囊腺瘤等，尽快安排手术。
卵巢囊肿与遗传因素、内分泌因素、环境因素、生活方式等诸多因素有关系。卵巢囊肿分为生理性的卵巢囊肿和病理性的囊肿，生理性囊肿可见于黄体囊肿、卵泡囊肿，这些囊肿可随着女性月经周期排卵可消失。生理性的卵巢囊肿可以不必处理，观察即可。
卵巢囊肿是属于一种炎症的表现，可以出现有疼痛的情况，主要是采取药物进行消炎和活血化瘀进行对症治疗，同时可以配合中医理疗红外线照射，热敷，艾灸等，这些都可以起到一个炎症消散的作用。不要有太大的心理压力，平时要养成良好的生活习惯，要积极的锻炼身体，增强体质，注意休息，保证睡眠。
中医讲究辨证论治。卵巢囊肿根据舌脉表现，痰盂凝结，痰饮停聚而导致气机气滞血瘀，痰饮与瘀血互结阻滞，或气虚血于导致血凝成于，发展为卵巢囊肿。可以区分为气滞、血瘀、痰湿及毒热的证型，需要根据不同证型而用药治疗。
卵巢是一对扁平性腺器官，卵巢囊肿是卵巢上出现囊性肿块的病变，分为生理性和病理性。其中生理性卵巢囊肿是卵巢的功能性改变，大部分体检做B超时会发现，多数情况下可自行消退；病理性卵巢囊肿常见于卵巢肿瘤主要包括上皮性肿瘤和生殖性肿瘤。卵巢囊肿发病原因众多，主要有遗传因素、环境因素或自身内分泌因素异常而引起。