子宫内膜异位症的病因至今不明。主要的学说及发病因素有：异位种植学说，即随经血逆流，种植于盆腔任何部位，也可通过淋巴或者静脉向远处播散；化生学说即体腔上皮受激素或生化刺激转化为子宫内膜样组织。诱导学说即未分化腹膜组织转化为子宫内膜组织。遗传因素；免疫与炎症因素与该病发生有关。这都是子宫内膜异位发生的原因。
子宫内膜异位症是子宫内膜种植在子宫以外的地方，比如种植在盆腔内。子宫内膜异位症的形成原因是在月经来潮期间有剧烈的运动，同房，则会导致经血逆行导致子宫内膜异位。
要是跟过多的人流，过多的生产以及经期性生活都有一定的关系。如果存在有子宫内膜异位症可以根据自己的生育需求情况，使用药物进行控制的。所以应该结合自己的病史，并到医院做好咨询工作，是可以治疗好的。
经血逆流：月经期子宫内膜腺上皮、间质细胞可经过输卵管进入盆腔，在卵巢和邻近的盆腔腹膜继续种植生长蔓延。医源性因素：由于剖宫产易将子宫内膜带至切口，直接种植导致剖宫产后腹壁子宫内膜异位症。家族遗传性：谷胱甘肽转移酶，半乳糖转移酶和雌激素受体的基因多态性与子宫内膜异位有密切关系。四、炎症因素及免疫因素等。
子宫内膜异位症的具体原因到目前不清楚，大多数都是和个人体质有关系，但是也有一些是和炎症，经期同房，经期剧烈运动，经血逆流，跟过多的人流，过多的生产以及经期性生活都有一定的关系。
子宫内膜是由刮宫，人流，或生产引起的，由子宫内膜的损伤才会引起子宫内膜异位症。子宫内膜异位症系子宫内膜组织出现在子宫体以外部位，主要诱因，经血倒流、淋巴及静脉播散、免疫及炎症等因素有关。