子宫腺肌病和子宫肌瘤病变所在部位都是子宫肌层，但是形成病变的组织是完全不同的，子宫腺肌病是子宫内膜腺体及间质侵入子宫肌层形成的病变，而子宫肌瘤主要是由子宫平滑肌细胞增生。
巧克力囊肿严格来说，属于子宫内膜异位症的一种疾病类型，巧克力囊肿的问题而引发痛经、阴道流血等不良后果，子宫肌瘤巧克力囊肿在性交过程中还会出现阴道疼痛不适表现，子宫肌瘤发病后会出现月经过多、腹部压迫有肿块等情况，但是子宫肌瘤主要长在子宫体上面，并且随着生理年龄的增大会慢慢缩小。
子宫肌瘤又称子宫平滑肌瘤，长在子宫体上，一般不会癌变，会随着闭经后子宫的萎缩而萎缩。巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一个表现，子宫内膜异位症在子宫体上称为子宫腺肌症或腺肌瘤，在卵巢上则称为巧克力囊肿。巧克力囊肿不会癌变。
子宫肌瘤和巧克力囊肿可以吃蔬菜、蛋类、瘦肉、稀饭、面条、馒头、米饭等食物，不可以吃辛辣食物和油腻食物，高脂肪食物是子宫内膜在子宫以外的地方，比如卵巢。会形成巧克力囊肿，伴随着来月经会产生疼痛，目前没有任何食物可以促进，子宫内膜异位症恢复，只有手术，或者是用，孕酮，或者是用肌注的方式出现闭经。
子宫肌瘤和卵巢巧克力囊肿的医治比较好的方法是通过药物医治，平时要饮食宜清淡，不能吃羊肉、虾蟹等发物，忌食辣椒、生葱生蒜等刺激性食物及饮料多吃蔬菜水果，平时多注意卫生。
子宫肌瘤是良性的肿块，一般小的肌瘤无需治疗，大于５cm子宫肌瘤是可以采取手术治疗，巧克力囊肿是子宫内膜异位症导致，可能出现疼痛，破裂的可能，需要到医院手术治疗。不要吸烟酗酒，月经时期不要吃冰冷的食物．注意少吃含有激素类的食物。