可以采用药物治疗，假孕疗法：应用孕激素类药物，保守性手术和半保守手术：前者切除病变组织，保留子宫卵巢，缓解和消除疼痛，改善和促进生育，手术：子宫卵巢同时切除。减少复发。
子宫内膜异位能否治疗好与病人年龄以及是否绝经有关，如果病人年龄较轻，或是刚结婚无孕者，患有此病会影响到卵巢的功能，甚至影响输卵管的功能，进而导致不孕，甚至出现终身不孕。另外如果卵巢一直存在或没有绝经时，子宫内膜异位随时有复发的可能。
子宫内膜异位只要病人接受正规、合理的治疗，子宫内膜异位症是完全可以治好的。如果子宫内膜异位病人的症状较轻微，服用一段时间药物即可痊愈。该病完全能够治好，不用担心。
通常情况下，怀孕不建议治疗子宫内膜异位症。
子宫内膜异位症简称内异症，是子宫内膜组织长在子宫腔和子宫肌层外面位置的一种疾病。患者通常有痛经、血尿、腰痛等不适症状，治疗内异症的目标是去除病灶、减轻疼痛、促进生长发育，而怀孕以后，患者体内雌激素水平会降低，导致异位子宫内膜没有充分的雌激素刺激，就引起异位子宫内膜萎缩甚至死亡，对于异位子宫内膜起到抑制的作用。但并不能去除病灶，减轻疼痛，因此怀孕一般不建议治疗子宫内膜异位症。
当患有子宫内膜异位症时，应积极就医，根据病因治疗。
如果不进行正规治疗方式，子宫内膜异位并不会自己痊愈，所以如果已经确诊是子宫内膜异位，就一定要及时前往当地正规医院进行诊断和治疗，千万不能拿自己身体开玩笑。
艾灸是能治子宫内膜异位的。因为子宫内膜异位症可以导致月经不调、痛经的情况，甚至还可以导致不孕不育的情况发生。艾灸对子宫内膜异位症还是有效果的，可以活血化瘀，对子宫内膜炎症可以起到消炎以及预防的效果。但是艾灸治疗见效慢，所以治疗需要耐心，坚持治疗。