卵巢囊肿分为生理性和病理性。生理性的比较小，会随着月经周期消失，不需要处理，密切随访就行，月经期避免长期久坐，注意腹部和腰部保暖。病理性的不会消失，要手术切除。对于育龄期的妇女，发现卵巢囊肿后，进行B超检查，如果为无回声没有分隔，先观察2到3个月，再复查彩超，囊肿持续增大，直径超过5公分，应进行手术治疗。
囊肿直径小于4-5cm，先观察2~3个月等月经刚干净时再复查一次，有时候就会发现囊肿消失了。这种囊肿叫生理性囊肿，与卵巢排卵有着密切的关系。卵巢每个月经周期都要排卵，在排卵过程中卵巢会发生变化，可能会形成黄体囊肿、滤泡囊肿等，这些囊肿通常会在月经来潮时消失。所以，在2~3个月后月经刚刚干净时复查，就会发现囊肿消失了。
10厘米的卵巢囊肿不能自行消失。卵巢囊肿有10cm，会把卵巢压坏，有恶性的可能，很严重，必须马上手术切除，现在可以采取腹腔镜微创手术，手术过程中会对囊肿做切片化验，45分钟后，可以知道囊肿的性质，要是恶性的囊肿，还需要化疗。
卵巢囊肿要看其大小，是否带蒂，如果囊肿较大，可以导致周围组织压迫症状，如果发生蒂扭转，可能导致急腹症的，要及时手术处理的。如果囊肿很小，经过动态复查生长不快，可以继续观察看看的，暂时不用处理。
卵巢囊肿会有自己消失的情况。卵巢囊肿根据其大小及性质分为赘生性囊肿和非赘生性囊肿。前者体积较大，一般直径大于5cm，多为病理性增生，不会自己消失，后者多为生理性增生，囊肿体积较小，直径很少超过5cm，囊壁薄，囊液清亮，多会自行消失。
卵巢囊肿如果有高回声区，就是实质性的病灶，囊肿高回声区说明局部密度增大，要早一点做手术切除。平时不要吃辛辣刺激的食物，可以做腹部CT检查确诊，确定囊肿的具体大小，及是否经常引起腹部疼痛等现象，然后结合自己的病症在做下一步治疗的计划。