应该注意定期作B超复查，防止复发。因为巧克力囊肿手术复发率很高，这种囊肿与周围组织粘连严重，在手术过程中囊液一旦外流，就可以到其他部位种植，引起复发。多吃些蛋白质多的食物，增加体力。
巧克力囊肿常规检查注意事项是要先监测有没有排卵。做个输卵管造影，看看输卵管是否通畅，子宫形态有没有异常。还要排除免疫性不孕。男方要查个精液常规和抗精子抗体。只有找到不孕的原因，才能有针对性的用药治疗。巧克力囊肿需要复查彩超，查CA125和抗子宫内膜抗体。
卵巢巧克力囊肿手术后注意事项：蛋白质可以帮助伤口快速愈合，增加体力，可以选择鱼类，因为鱼肉比较容易消化和吸收。还要避免食用油腻的食物，因为脂肪会形成堆积，使伤口不能快速愈合，对细菌的抵抗能力也是会减弱的。别吃含激素类食品，比如鸡蛋、大豆、蜂王浆等。不喝浓茶，可乐，咖啡及碳水化合物的饮料。少吃辛辣，高脂高蛋白食品及精加工食品。
巧克力囊肿术后饮食，没有什么明显的饮食禁忌，对于新鲜的水果、蔬菜、鱼、虾、瘦肉、鸡蛋、牛奶均可以食用。但是对于比较特殊的食物，比如豆制品、豆浆、蜂王浆，尽量减少食用或者是不食用。
卵巢囊肿穿刺术后，如果是经阴道穿刺的，两周之内不要有性生活，注意消炎，其它的没有什么特别注意的。你这期间不要吃辛辣刺激性的食物，以后尽量采取安全措施同房比较好。
行经前后，注意进食过热的汤、菜，生冷食物均属禁忌。谷类、豆类、薯类作为主食，均可食用，无需避免；肥厚油腻，易于滞瘀，少食为好；清淡疏利之品较为适宜；干果不忌，可随时食用；养生行血，核桃温阳，大枣、桂圆益气养血，更为适用；家禽家畜、蛋乳、鱼鲜一般均可食用，气血虚少者用以益气养血效果较好。田螺、蛤蚌、蟹、鳖偏凉食，宜少食。过于肥厚之肉品忌食。