卵巢囊肿是一种良性的病变，如果把他脑子的体积不大，比如在5公分之内，还有自限性，对怀孕影响不大。对于伴有月经不调的应积极调理月经，往往会发生一些不良的后果，像腹痛、扭转、感染，还有极个别的发生恶变，会因为对内分泌和排卵的影响而导致不孕。
生理性的卵巢囊肿直径不会超过5厘米。直径小于4厘米的生理性卵巢囊肿都可以不用治疗，病人只要做好定期的检查观察就行。超过4厘米就要手术切除了，应该观察一段时间。看消失还是增大。
卵巢囊肿分为生理性和纯囊性，一般小于5cm的囊肿考虑为生理性的，每3个月复查B超就可以了，而且大部分会自行缩小或消失，但也可能在另一侧卵巢或同侧卵巢在长出来。卵巢囊肿大于五厘米，可以考虑手术，但并不是说到五厘米了，必须通过手术来治疗，也可以先吃药，而且有的人没有症状，观察就行，或者做一个标志物的检查，检查结果都是正常的，说明没有发生癌变，暂时就不用考虑手术。如果短时间内有明显的增大，再考虑手术就可以了。
卵巢囊肿一般在5cm以内通过服用药物采取保守治疗；在5cm以上一般医生会建议手术治疗。卵巢囊肿不及时治疗，否则可引起内分泌失调、下腹疼痛水肿；如果怀孕容易引发流产；严重者可以导致不孕等情况发生。
女性体内激素水平紊乱，或者妇科炎症都可能造成卵巢囊肿.
首先需要知道所患的卵巢囊肿是生理性卵巢囊肿，还是病理性卵巢囊肿。生理性卵巢囊肿是由于在排卵期后，由黄体期所形成的囊肿，一般是小于5厘米。在黄体期结束之后，激素水平下降，就会自动消失的，并不需特殊处理。而由于炎症导致，以及内分泌紊乱或者遗传因素所导致，还有子宫内膜异位症所导致的卵巢巧克力囊肿等，就需要根据病情来进行治疗。