相对于人工流产来说，药物流产对患者的伤害并不大。
人工流产是一项有创性的手术，需要用负压吸取孕囊、血液等组织，在人工流产过程中难免会对宫腔产生伤害。而药物流产是一种可以终止怀孕的方法，是指口服药物终止早期妊娠，在药流后要到医院做B超，确定是否是子宫内怀孕后再进行药物人流。在恢复期要多休息，不要食用辣椒、大蒜等辛辣刺激的食品。
正常情况下人流伤害更大。药流和人流都是终止早期妊娠的一种方法，对身体都是有危害的。人流是通过手术器械进行宫腔负压吸引，将妊娠物吸出宫腔外，对身体损伤相对会比较大。药物流产则是通过米非司酮和米索作用人体，使妊娠物与子宫内膜剥离，并通过子宫收缩将其排出体外，对人体特别子宫内膜的损伤相对比较轻，但是如果药流流不干净的情况下，还是需要进行清宫处理，这样伤害就会比人流大。建议：平时一定要做好避孕措施，另外要注意性交卫生，控制性生活的频率，不宜太过频繁。
药物流产适用于怀孕49天以内的，如果怀孕没有超过49天，做彩超检查可以确诊为宫内孕，就可以服用药物流产药，药物流产相对来说比人工流产对子宫内膜的损伤要小一些。但是药物流产有可能会流不干净，如果宫腔内不能彻底排干净，就需要再做清宫手术。
药流的成功率约为75%。若药流不净，残余的胎膜组织会造成血崩，须立即入院刮宫，否则会有生命危险。人流的成功率能达90%，少有流产不干净的情况产生。若手术中出现情况，会立即有反应，可及时得到有效治疗，人流的成功率远远大于了药物流产。
药流伤害大，一般药物流产是末次月经后四十九天之内进行，孕囊还没有完全着床，还没有稳固情况下刺激子宫收缩，内膜脱落，从而达到流产目的，人工流产末次月经后四十五天B超可见孕囊后可以直接进行，不用担心残留问题，相对直接彻底。
清宫和药流对比来说，药流对身体的危害要比清宫大，而且弊端比较多。但是选择清宫还是药流需要根据患者的实际情况来判断。
药流是在女性怀孕7周之内进行的流产方式，清宫多在怀孕3个月之内进行。药流虽然是无创的，避免了宫腔内操作可能引起的感染，但是会引起剧烈腹痛，且流血时间长，药流后容易有残留，需要二次清宫。而清宫手术成功率高，流血时间短，对身体危害比较小。