一般情况下，药物流产在服用完两种药物后的2-6小时可以排出孕囊。
通常，药物流产需要服用米非司酮片、米索前列醇片这两种药物来促进孕囊排出，从而终止早期妊娠。女性需要服用完米索前列醇片后的2-6小时左右来将孕囊排出。药物流产，在妊娠囊排出之后，子宫腔内增生的子宫脱膜组织并不能同时排出，需要在妊娠囊排出后的一周左右，才会逐渐将坏死、脱落的子宫脱膜组织排出体外，所以，药物流产后的出血时间相对较长，出血量相对较多。
在服用最后的三片药后才会出现腹痛，出现阴道流血以及孕囊排出，如果确实没有看到孕囊排出，需要去医院做下B超，看B超检查的结果决定是否需要清宫处理的，流产后一个月内要禁止性生活，禁止盆浴，不吃冰冷的辣的刺激性食物。
通常情况下，药物流产会流出胎囊。具体情况分析如下：
如果不能排出胎囊，患者可以通过人工流产来清除蜕膜和胎囊。不过，药物流产的适应症也要注意，停经49天以内，胎囊的直径小于2.0cm，通过B超可以看到子宫内的胎儿体积越小，那么药物流产的几率就越大。而且在药物流产的时候可能会出现过敏、流产不全、大出血等症状。
药物流产服用完所有的药物2-6小时即可排除孕囊，服用流产药物进行流产，妊娠囊排出以后，宫腔内增生的子宫脱膜组织并不能同时排出。都会在妊娠囊排出后的一周左右，才会逐渐的将坏死脱落的子宫脱膜排出体外，导致药物流产后的出血时间相对延长，出血量相对增多。药物流产后注意观察，如出血量超过平时的月经量或者是出血时间超过十天不干净，要引起重视。
药物流产流血要7到10天左右，最长不能超过半月。如果患者阴道流血时间超过半月或者流血量比较多，就要考虑药流不全、子宫复旧不良、宫腔感染、滋养细胞疾病等可能性。患者需要做妇科彩超，血常规，c反应蛋白，血绒毛膜促性腺激素等相关的检查来进行鉴别诊断。如果是残留，则需要清宫手术进行治疗；如果是感染，则需要抗炎治疗；如果是子宫复旧不良，则需要使用缩宫素，促进子宫收缩治疗；如果是滋养细胞疾病则需要化疗。
孕囊在0.5-2.5cm间适合做药物流产，这时大约在怀孕35-49天之间，如果孕囊太小这时激素水平比较低，对药物敏感性也比较差，容易造成不全流产。如果是孕囊太大，超过2.5cm说明怀孕时间比较长，如果用药物流产有时可能会出现大出血，有时可能会出现不全流产。所以选择在孕囊0.5-2.5cm间，这段时间做药物流产，则完全流产率是比较高且出血比较少，安全性比较大。