治疗要明确是那种疾病再进行治疗，可以到正规医院内分泌科或外科就诊检查，根据病情采取激素类药物、手术、放疗等方法治疗。甲状腺-肾上腺皮质激素、性激素替代疗法，适用于全垂体功能衰退引起的多腺体功能减退者。垂体性闭经-手术和放射疗法垂体性闭经-食疗。
子宫偏小引起的闭经以中药调理为主，西药为辅，通过调理自身的气血、化瘀散结、补益冲任，调理女性各脏器的功能，从而调节体内的内分泌均衡。女性一旦出现闭经的状况，一定要到医院治疗。只要科学及时的治疗，还是完全可以好的，女性要重视自己的健康，无论何时都要以健康为重。
下丘脑垂体性闭经是由于下丘脑激素分泌异常导致的闭经。一定要在第一时间去治疗才行，可以尝试使用激素治疗的方法或者是药物治疗的方法，或者是中医针灸治疗的方法。平时注意卫生，避免辛辣刺激的食物。
甲减治疗很简单，就是补充甲状腺素治疗，根据甲状腺功能的具体数值确定用量。每月查甲状腺功能，调整药量，一般需要把促甲状腺素调整在2.5uiu/ml以下再考虑妊娠。还要适当补钙。
肺结核可能会影响月经。如果结核病得到控制，月经将恢复正常。结核病很容易影响生殖系统，主要表现为子宫内膜损伤和输卵管损伤，子宫内膜损伤不易恢复。：如果闭经难以恢复，去医院看看目前的情况是否需要治疗。
药物引起的女性闭经首先就是要停止服用该药物，先观察一段时间，能否自行恢复月经的情况，后期可以监测一下内分泌的情况，监测一下看内分泌各项是否都正常，一般长期服用某些药物会打乱身体的内分泌系统，导致内分泌紊乱。