子宫肌瘤是良性肿瘤，而且是激素依赖性肿瘤，是由子宫平滑肌细胞增生而形成的团块，而子宫囊肿多指宫颈的囊肿，宫颈的囊肿是在宫颈炎症修复过程中，使腺管阻塞里边的粘液没有办法流出的情况下而形成的小囊肿。
巧克力囊肿是卵巢的，子宫肌瘤是子宫的。子宫肌瘤长在子宫体上，一般不会癌变，会随着闭经后子宫的萎缩而萎缩。巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一个表现，子宫内膜异位症在子宫体上称为子宫腺肌症或腺肌瘤，在卵巢上则称为巧克力囊肿。巧克力囊肿不会癌变。
子宫腺肌病和子宫肌瘤病变所在部位都是子宫肌层，但是形成病变的组织是完全不同的，子宫腺肌病是子宫内膜腺体及间质侵入子宫肌层形成的病变，而子宫肌瘤主要是由子宫平滑肌细胞增生。
通常情况下，宫颈纳氏囊肿是一种生理变化，一般不需要做什么特别的处理，也不用什么药物，也不用外科手术，但是想要去除这个囊，就必须要做外科手术，将囊内的液体全部清除掉。
因为子宫肌瘤的大小和部位不一样，治疗方法也会有很大的差别，如果是小的，可以口服桂枝茯苓丸，如果是大的，则要做开腹手术，或者是腹腔镜进行检查。
宫颈囊肿是因为宫颈出现了新的鳞状上皮，将腺管中的腺管堵塞，从而导致腺管中的分泌物滞留在腺管中，不能排出。而子宫肌瘤则是因为女性体内的雌性荷尔蒙分泌导致的。如果是更年期，如果没有任何的合并症，那么就应该进行常规的检查，需要及时前往医院就诊，明确病因后对症治疗，以免延误病情的诊治，治疗期间要注意做好保暖工作。
子宫肌瘤通常位于子宫体部，与子宫相连，而卵巢囊肿则通常位于子宫两侧附件的位置，多见于卵巢和输卵管，若为无法区分的肿瘤可通过检测手段或者手术鉴别；大多数子宫肌瘤病人均无明显症状，仅部分病人表现为经量增多、经期延长、严重贫血以及明显腹痛，卵巢囊肿体积较大则症状明显。