卵巢囊肿手术不算大手术，因为各级医院的收费标准是不同的，手术的性质也是不同的，有开腹手术，还有做腹腔镜手术两种。所以费用上也有所差距。三甲医院做手术，采用腹腔镜治疗的话，大概费用应该在1万多。如果仅仅是开腹治疗的话，那么有几千块钱就可以了。
卵巢囊肿手术的花费个区域是不同的，由于各地区的消费水平不同，所以手术在各个不同的地区，不同级别的医院所花费的费用也是有所不同的。在同一医院内，腹腔镜手术要比开腹手术费用高一些。一般在公立医院，如果是开腹手术，卵巢囊肿病人从住院到出院，没有手术并发症，需要5000到6000元。如果是腹腔镜手术则需要7000到8000元。在私立医院或者是外资医院所需要的费用就比较高。
如果卵巢囊肿选择微创手术，在三甲级别的医院做，一旦用腹腔镜，费用至少20000元以上，一般是20000-30000元之间。以下为常见一般公立医院收费参考：卵巢肿瘤是女性生殖器常见肿瘤，有各种不同的性质和形态，即一侧性或双侧性、囊性或实性、良性或恶性，其中以囊性多见，有一定的恶性比例。卵巢囊肿类型不同、治疗方法不同，手术难易程度和术后辅助治疗也存在不同。良性卵巢囊肿治疗费用约几千到一两万块钱不等；恶性或交界性肿瘤，手术范围较大，术后需辅助化疗等治疗方式，费用较高。
一般情况下，卵巢囊肿腹腔镜手术的费用在1万左右，医院的等级以及药物使用情况会决定具体的费用，具体如下：
在女性去医院检查彩超时，如果发现大于5公分的卵巢囊肿，一般建议使用腹腔镜手术将卵巢囊肿剥离。因为囊肿太大，为避免囊肿扭转和破裂在剧烈活动或者体位改变后就可能出现，建议卵巢囊肿腹腔镜手术后，患者应当卧床休息一周左右的时间，需要等到腹部切口正常恢复后，便可正常活动。
卵巢囊肿做手术需要5000元-10000元。因为卵巢囊肿不会导致月经量多注意休息，避免劳累。如果B超检查卵巢囊肿增长的速度比较快，可以微创手术，手术的费，每个医院的收费价格不一样的。