卵巢囊肿48mmx36，手术时是不是要切除卵巢取决于卵巢囊肿的性质。如果卵巢囊肿是良性的，是不需要切除卵巢的，只需要将卵巢囊肿从卵巢中剔除就可以了。但如果卵巢囊肿是恶性的，不仅需要切除卵巢，还需要切除子宫，输卵管，然后进行淋巴结的清扫。而卵巢囊肿性质的判断需要结合核磁共振检查、超声检查，以及术中冰冻病理共同决定。
卵巢囊肿是不需要切除卵巢的。卵巢对于女性非常重要，如果完全切除一侧卵巢，虽然还有另一侧卵巢，但是如果是另一侧卵巢功能丧失或者出现囊肿，就给女性会带来很大的困惑，会出现更年期提前的症状。所以临床上对于卵巢囊肿的手术，只要单纯的将囊肿剥离下来，然后缝合剩余的卵巢组织就可以。
卵巢囊肿是妇科常见病，卵巢囊肿是否需要进行手术切除，需要专业的医生进行判断，借助B超、CT、核磁等影像学检查、实验室检查结果初步判断肿瘤性质。卵巢单纯性囊肿，直径＜5公分，可观察2-3个月，如自行消失属于功能性囊肿，如持续存在、继续生长，则需手术治疗。
卵巢囊肿并不一定需要手术切除。可以做B超明显大小后再确定方案的。如果较小可以不必做手术，正常治疗即可。超过五厘米的囊肿才是需要考虑做手术的，因为囊肿太大，药物治疗没有效果，同时持续增大，可能会发生疼痛，内出血，风险就会比较大。
一般说直径超过七个厘米才考虑手术切除囊肿。如果说能够做囊肿剥出手术，一般不建议切除卵巢。如果说囊肿已经非常大，已经看不到了正常的卵巢组织，那么也可以将这一次卵巢全部切掉因为女性有软两个卵巢切除一侧对女性的性功能并没有什么影响。
本病多为良性病变，通过治疗可以治疗好的，是否切除卵巢，是要根据术中具体情况而定。怀疑恶性肿瘤需要手术完全切除，术后需要辅助放化疗，中医中药综合治疗。因此在医生指导下治疗就可。