一般情况下，卵巢囊肿腹腔镜手术的费用在1万左右，医院的等级以及药物使用情况会决定具体的费用，具体如下：
在女性去医院检查彩超时，如果发现大于5公分的卵巢囊肿，一般建议使用腹腔镜手术将卵巢囊肿剥离。因为囊肿太大，为避免囊肿扭转和破裂在剧烈活动或者体位改变后就可能出现，建议卵巢囊肿腹腔镜手术后，患者应当卧床休息一周左右的时间，需要等到腹部切口正常恢复后，便可正常活动。
卵巢囊肿手术不算大手术，因为各级医院的收费标准是不同的，手术的性质也是不同的，有开腹手术，还有做腹腔镜手术两种。所以费用上也有所差距。具体的费用，建议咨询一下想就诊的医院，建议术后注意休息，保持心情舒畅。
如果卵巢囊肿选择微创手术，在三甲级别的医院做，一旦用腹腔镜，费用至少20000元以上，一般是20000-30000元之间。以下为常见一般公立医院收费参考：卵巢肿瘤是女性生殖器常见肿瘤，有各种不同的性质和形态，即一侧性或双侧性、囊性或实性、良性或恶性，其中以囊性多见，有一定的恶性比例。卵巢囊肿类型不同、治疗方法不同，手术难易程度和术后辅助治疗也存在不同。良性卵巢囊肿治疗费用约几千到一两万块钱不等；恶性或交界性肿瘤，手术范围较大，术后需辅助化疗等治疗方式，费用较高。
右侧卵巢囊肿，做手术治疗，如果是普通的手术费用也就三四千元，如果通过介入的方法做手术，手术费用还高一些，得1万元左右，不过医保能够报销一部分手术费用，一般术后得住院观察一周。
卵巢囊肿是妇科常见病，是一种良性疾病，小于5CM的卵巢囊肿常常是不需要治疗的，常常可以自行消失，大于5CM的卵巢囊肿有可能是病理性囊肿，可以选择腹腔镜下卵巢囊肿剥除术，或者开腹下行卵巢囊肿剥除术，手术费用在1万-1万五千元。