小儿泌尿系统感染症状因年龄和尿感部位不同而异，新生儿以败血症、脑膜炎及全身中毒症状为主要表现，常表现为精神淡漠、拒奶、激惹或体重不增；婴儿常表现为发热、吐泻、体重不增；而儿童除有发热、寒战外常有尿频、尿急、尿痛、下腹痛、腰痛及肾区叩痛等。
儿童发生泌尿系统感染症状通常比较明显。排尿时会感到尿道口灼热感、排尿次数频繁、背部下方或腹部疼痛、发生尿床、血尿(尿液颜色可能是红色、粉红或暗红色)。父母一旦发现自己的小孩出现泌尿道感染的症状，应尽早带孩子去医院就诊，证实是尿道感染，应多饮开水，以增加尿量、冲洗尿路。同时，要在医生的指导下选用抗菌药物治疗。
泌尿系统感染的主要症状是尿频、尿急、尿痛和尿不完全，这可能是平时不注意个人卫生或感冒引起的。消炎药物和清热降火药物可以口服，多喝水，利尿，冲洗尿道，多吃新鲜蔬菜水果，禁止吃冷、凉、辣等刺激性较大的食物。
由血行感染所致以全身症状为主，如发热、呕吐、腹泻、腹胀等，多数小儿可有生长发育停滞，体重增长缓慢；婴幼儿期仍以全身症状为主，偶可出现黄疸；儿童期下尿路感染时，大部分患儿仅表现为尿频、尿急、尿痛等症状，有时可有血尿，而全身症状多不明显，上尿路感染时表现为发热、寒战等，可伴腰痛及肾区扣痛。
轻者可以毫无症状，仅在尿培养时有细菌生长；重者发热或体温不升，面色灰白，易激惹或嗜睡，有的还可以表现为黄疸、惊厥或消化道症状。婴幼儿患病时，全身症状明显，如发热、面色苍白、呕吐、腹泻、腹痛、腹胀、亦可出现神经系统症状如烦躁、嗜睡、惊厥、昏迷，泌尿道症状较轻时，仅表现为排尿时吠吵。