宝宝吃母乳腹泻可以遵医嘱使用药物进行治疗。
宝宝吃了母乳会拉肚子，这属于一种生理的拉肚子，因为母乳属于流食，宝宝的消化能力强，所以宝宝会有拉肚子的症状。也可能是因为对母乳的敏感引起的，可以口服一些可以调节消化道的药物，例如枯草杆菌二联活菌颗粒，但千万别乱吃，以免加重宝宝的胃肠负担。同时需要停止哺乳，可以选择用牛奶替代母乳喂养。
宝宝吃母乳腹泻，母亲的饮食要以清淡的食物为主，尽量少食用油腻食物，其次孩子可以尝试着使用脐贴来缓解一些症状。如果是情况比较严重的，可以去医院儿科进行就诊，遵医嘱进行治疗。
考虑孩子年龄太小，胃肠功能发育不完全，容易有消化不良的情况。可以给孩子口服补充一下肠道益生菌，如果一段时间后仍没有改善，就需要尽快带着孩子到当地正规医院儿科就医检查并治疗了。
宝宝吃母乳拉肚子时，应该及时就医，在医生的指导下，进行对症治疗。以母乳为主要诱因的小儿的腹泻，临床上叫做母乳性腹泻，一般多发生在六个月以内，纯母乳喂养的宝宝身体上。一般母乳性腹泻的宝宝无需治疗，就是继续哺乳就可以了，随着宝宝成长，添加辅食自然就会好转。但是如果宝宝有发热呕吐、小便减少、或者体重增长不佳，就要及时就医了。
宝宝母乳性腹泻，也属于是宝宝的生理性腹泻。因为宝宝月龄小，所以消化系统、神经系统发育不完全，消化能力较弱，经常会出现消化不良、腹泻的症状，大多是由于宝宝对母乳当中的乳糖不耐受所引起的，一般一岁左右就会自愈。添加辅食之后，大便就会逐渐转为正常的。
如果不严重先不要吃药，继续母乳，妈妈的饮食要注意，不要吃太凉的。也可以先化验一下大便常规，服用一些药物治疗。平时饮食清淡为主，多吃富含蛋白质的食物，保证睡眠，避免劳累。