三个多月婴儿便秘的原因很多，如下：
1，如果患有先天性巨结肠、甲状腺功能低下等疾病，此时可能会出现该症状；
2，如果是食物过敏导致的，如牛奶、母亲过敏等，此时可能会出现该症状；
3，如果是儿童的肠道微生态系统不健全、疾病等原因导致的，此时可能会出现该症状，可以多吃富含纤维素的食物，如菠菜、胡萝卜、苹果等，对身体有好处。
便秘与食物的成分关系密切，如食物中蛋白质含量过多而糖类不足，使肠发酵相对减少影响发酵，使大便呈碱性，干燥导致便秘。食物（如奶粉）中含大量的酪蛋白，粪便中含多量不能溶解的钙皂致粪便增多，容易便秘。
便秘可能是胃肠道发育尚未完善，会出现便秘的现象，适当的加用些蔬菜水果是否可以改善症状，在两次喂乳之间喂新鲜果汁或白开水，其次多饮水随着孩子的生长发育，便秘的现象可以得到改善的慢慢来即可。
宝宝可能是胃肠道蠕动功能较差，也可能是消化不良。也可能和母亲的饮食有很大的关系。注意母亲的饮食，一定要多喝水，多吃新鲜的水果蔬菜，一定要保持大便通畅。不要吃辛辣，太油腻的食物。首先让宝宝少量多次喝水，可以适当的添加辅食，多吃点儿水果蔬菜泥，多给宝宝按摩腹部，但是宝宝是不主张使用化学药物的。必要的时候可以给宝宝喝点儿葡萄糖水，但是不可以喝蜂蜜水啊。可以通过健脾消食润肠通便的药物进行调理身体当小孩在哺乳期间身体出现了便秘的情况，建议通过调整胃肠菌群以及健脾消食助消化的药物进行综合治疗。
经常便秘的原因如下：
出口梗阻，直肠前突或者传输障碍存在等都可能会导致出现经常便秘的情况，建议患者根据自身实际情况及时前往医院就诊，通过结肠镜检查、排粪造影和传输实验等方式明确具体的病因后，在医生的指导下进行针对性治疗。患者平时要戒烟戒酒，清淡饮食，不吃辛辣刺激的食物，多吃新鲜的蔬果，适当运动，比如慢跑、游泳等，有利于身体健康。
