过度使用抗生素会导致胃肠不适和其他胃肠反应，如腹胀、腹泻、便秘、恶心和呕吐。有肝损伤、过敏反应、贫血、神经系统损伤等。如果使用长期或大剂量抗生素，也可能导致继发性感染。此外，如果长时间使用抗生素，细菌会产生耐药性。因此，不要长期盲目大量使用抗生素。
部分人对有些种类的抗生素有过敏反应，轻者会出现发热、皮疹、恶心、呕吐等过敏症状，严重可导致呼吸困难、休克甚至死亡等严重的副作用。多种抗生素都有毒副作用，过量使用可导致耳聋、白细胞减少、再生障碍性贫血、神经系统损伤等毒副作用。
抗生素后的调理饮食，可以口服健脾消积的口服液，或者是多吃一些容易消化的食物，促进消化的食物，比如山楂，鸡内金，如果出现继发细菌感染所导致的真菌感染，可以口服益生菌，调节肠道，同时要加强护理，多晒太阳，青菜等消化饮食，尽量的通过护理，饮食，按摩等这些方式来缓解抗生素后的一些问题，达到调理身体的目的。
哺乳期使用抗生素对宝宝的危害性如下。
女性在哺乳期使用了抗生素可能会对宝宝造成肠胃功能紊乱，会导致宝宝出现呕吐、腹泻、腹胀、食欲减退的症状，甚至会引发宝宝患有皮疹。如果必要时要使用抗生素，需要在医生指导下，且有指征的情况下才能进行使用。
建议女性注意哺乳期注意饮食清淡，多吃新鲜的蔬菜和水果，不要食用辛辣、刺激的食物，适当进行户外运动。
细菌性肠炎在正常使用抗生素的情况下是不会导致小孩身体健康的。并且可以缩短病程减轻小孩，因为常肠炎腹泻导致的营养不良，及生长发育，抗生素会有一定的副作用，但很小。去医院开相关药物，病情基本可以康复，而且可以防止小孩因，腹泻导致营养不良。
感冒是有病毒感染引起的，是不需要吃抗生素的，况且吃抗生素后还会造成过敏，以后宝宝耐药等不良反应。多饮水的，平时注意给宝宝不要捂得太厚的衣服的，但是不要轻易吃消炎药。