三个月宝宝肠炎原因可能是病原体感染。
肠炎是一种由细菌、病毒、霉菌、寄生虫等所致的肠道疾病。常见的症状有恶心、呕吐、腹痛、痢疾、稀水便、粘液脓血便等，也有一些患者会出现发烧，这就是感染性痢疾。根据病程的长短，肠炎可以分为急性期和慢性期。家长要注意婴幼儿肠炎的护理：首先，在平时要注意给宝宝补充液体，避免因为粪便中的水分流失过多而导致脱水，可以适当的给孩子喝一些水，比如米汤和果汁。其次，还可以采取饮食疗法，调整膳食，坚持吃东西，哺乳的婴儿应该继续哺乳。如果婴儿没有哺乳，可以用平时吃的奶粉或奶制品来喂养。此外，还要做好消毒和隔离，餐具、杯子、瓶子要进行消毒，衣服要经常洗和晾干。
结肠炎和肠炎的区别，主要在发病原因以及发病部位上决定的，一般的结肠炎大部分指的是溃疡性结肠炎。肠炎泛指的是因为饮食不节造成的急性肠炎，如果急性肠炎得不到及时的治疗，就会慢慢迁延成为慢性肠炎。
肠炎患儿通常有厌食、发热、呕吐、腹痛和腹泻等症状。如果孩子有情况或父母有任何疑问，应尽快带孩子去看医生。在肠炎恢复期，应特别注意饮食控制。饮食中应多吃一些蔬菜、软腐温热的食物，以免过早食用脂肪、油炸食品、冷硬食品和多纤维食品。
饮食欠规律：饮食是肠胃的最大侵袭者，甚至有肠胃医生坦言：直肠炎就是吃出来的。如果一个人在饮食上长期不规律或无节制，那么很容易导致直肠炎的发生；病毒及病菌感染：这在直肠炎形成的原因中是最常见的因素，只要直肠粘膜或肛门粘膜的免疫力出现异常，一系列病菌就有可能引发局部感染，进而产生直肠炎症。
长期的慢性炎症可能是引起肛门直肠炎的要素。如慢性细菌感染、慢性非特异性结肠炎等，使得粘膜发生肉芽肿、炎性变和假息肉阶段而发生炎变。此外，痔疮、肛瘘、肛裂、毛囊炎等长期刺激肛门皮肤，也可引起炎变。饮食不慎、过度饮酒、过食刺激性强的食物等，不适当的长期服用泻药，肛门内腐蚀性药物过多，细菌感染均可引起直肠炎。