通常情况下，对于儿童化脓性扁桃体炎，可以选用一些抗生素进行抗感染的药物。
常见的有阿莫西林、克洛干混悬剂、青霉素、头孢等。对青霉素、阿奇霉素、克拉霉素等药物有敏感反应。
宝宝要多喝水，平时的食物要以清淡的方式来消化。化脓性扁桃体炎不仅会导致咽痛，还会导致发烧。如果宝宝的温度在38℃以上，可以服用一些退烧药。
通常急性化脓性扁桃体炎即腭扁桃体急性化脓性炎症，儿童和青少年较为多发。在春秋气温变化时经常发生。
小儿急性化脓性扁桃体炎的主要症状有：发热、畏寒、头痛、食欲减退等，发生高热的情况下可能会导致呕吐、抽搐、昏睡、咽部疼痛、吞咽困难。治疗主要是口服青霉素类的抗生素或静脉滴注，有高热症状的患儿还要用解热镇痛药物，多休息，要吃流质食物，补充营养，保持大便顺畅。
通常情况下，小儿化脓性扁桃体炎病程是3-10天左右。
小儿化脓性扁桃体炎一般是溶血性链球菌感染引起的，早期一般表现为持续高热、咽痛，而后当扁桃体处出现脓性斑点，主要是革兰氏阳性球菌感染导致，可以使用青霉素类的抗生素治疗。一般3到5天体温可以恢复正常，但是如果孩子扁桃体仍然有红肿，脓苔不一定会马上消退，这时候仍需继续治疗，直至脓苔消失，总的疗程可能会达到10天。
化脓性扁桃体炎一般不建议过早停药，以免治疗不彻底，引发心肌炎、急性肾小球肾炎。
小儿化脓性扁桃体炎主要是以抗炎、抗感染、对症治疗急性的炎症症状为主。若患儿病情反复，可诊断为慢性扁桃体炎，则在炎症被控制两周时间后，即非急性期进行手术切除治疗。
如果炎细胞不是非常高，可以尝试口服消炎药物，临床用的是头孢地尼分散片或者头孢克洛颗粒。积极治疗一段时间后，孩子扁桃体化脓的情况应该就会有好转。如果孩子的炎细胞很高，需要使用头孢呋辛或者头孢哌酮注射液进行消炎，使用之前都需要进行皮试。
化脓性扁桃体炎，首先，需要抗炎、抗感染治疗。因为扁桃体已成为脓性、脓栓等表现，同时，可配合相关药物。如果伴随有扁桃体周围脓肿，需要做切开引流治疗，配合治疗。如果出现憋喘，需加用激素类的药物。