治疗盆腔子宫内膜异位症的方法有使用药物和手术。女性盆腔子宫内膜异位症容易出现反复发作的情况，需要根据患者年龄、是否生育要求、具体症状等情况进行个性化的处理。以下是具体的处理方式：
1、对于无临床表现的病人，可以采取定期随访的方式处理。
2、症状轻微，同时有生育需求的患者，可以采取药物，如果药物无效，则需要外科手术。
3、症状较重、年轻、有保留生育能力的患者，应行卵巢囊肿摘除、骨盆内膜异位病变的手术，并定期进行随访或进行药物辅助。
4、对于无生育需求和严重临床表现的患者，可以采用根治性手术进行治疗。
盆腔子宫内膜异位症可以通过药物治疗，也可以通过手术治疗，需要看病情采取不同的治疗方式。治疗期间要注意饮食规律，保证足够的睡眠。还要适当的锻炼身体，提高自身的免疫力，多喝温水，多吃新鲜的蔬菜和水果。
盆腔子宫内膜异位症会出现痛经的症状，痛经的存在一般分为生理性疼痛和病理性疼痛，其中子宫内膜异位症就是痛经的常见原因之一。或者会引发性交疼痛，女性患上子宫内膜异位症后，会发现在同房的过程中，会有明显的痛感，甚至在生理期排便的过程中，疼痛也会较为敏感。
子宫内膜种植在子宫以外的部位称为子宫内膜异位症(巧囊），导致不孕、流产、性交痛、痛经等。腹腔镜下异位灶剪灭术，被誉为诊治的金标准。怀孕也是治疗措施之一，药物只是辅助治疗。手术越早越好，因为内膜异位被称为良性“癌症”，会无限制的生长，1期术后无需药物治疗，可以治好。2-4期就需要配合药物治疗了。
子宫内膜异位症会影响怀孕。子宫内膜异位症对怀孕的影响主要体现在子宫内膜异位症，可以引起盆腔的微环境改变，影响受精卵的结合以及运送。子宫内膜异位症可以引起女性免疫功能异常，导致子宫内膜抗体增加，破坏子宫内膜正常的代谢及生理功能。子宫内膜异位症会影响卵巢功能，导致排卵障碍和黄体形成不良。
子宫内膜异位症的检查有影像学的检查、B型超声检查，是诊断子宫内膜异位症的重要方法。可诊断内膜异位症的位置、大小、形状，其诊断的特异性、敏感性非常高。盆腔CT以及盆腔核磁，对盆腔内膜异位症有诊断价值，但是，因为费用比较高，所以一般不作为常规的检查方法。