卵巢囊肿可能误诊，但几率相对较小。
在所有的妇科肿瘤里，最常见的就是卵巢癌。囊性囊肿分为囊性、囊实性和实性三种类型。特别是恶性的卵巢上皮癌，伴随着与之对应的肿瘤有关的抗体。但有些恶性肿瘤，不会出现明显的抗体增高或者是不正常的情况，所以在手术中，很容易出现错误的情况。大部分的错误诊断都是因为癌症的本质而导致的。而手术后的组织学检查，则是最好的判断依据。总的来说，在手术之前或治疗之前，误诊的可能性很低。
宫外孕如果发现的比较早，没有发生破裂的情况下，可以进行保守治疗。保守治疗主要是应用杀胚药物终止妊娠。然后用活血化瘀作用的中药促进包块的吸收。可以保守治疗宫外孕的需要住院，在医生护士的密切观察下进行治疗和检查，一旦保守治疗失败仍需手术治疗。
如果是遗传导致的，或者存在手术不完全的情况，卵巢囊肿容易复发；但其它情况一般容易复发。
卵巢囊肿是否会复发主要与遗传因素有关，某些患者的体质本身就比较容易形成囊肿，因而术后卵巢囊肿复发的概率也较普通人更大。同时如果手术过程中选择的是卵巢囊肿剔除术，囊壁剔除的不完全，有残留的话，则很有可能出现术后囊肿复发。
此外，如果不存在上述情况，卵巢囊肿一般不容易复发，注意复查即可。
容易长卵巢囊肿的原因与环境饮食和激素等有很大关系。
环境污染、电离辐射等都会对女生造成影响，进而对激素的分泌也会造成干扰。除此以外，饮食结构的失衡与过量摄入胆固醇，也会诱发卵巢组织异常增生，导致囊肿的形成。使得卵巢囊肿患者体内激素水平存在特别明显异常现象，揭示激素在本病发生和发展中起到了重要作用。
建议平时要保持健康的饮食习惯，良好的心态，不烦躁。而且要注意个人卫生，保持健康的生活方式。
吃激素类食物容易长卵巢囊肿。豆制品少吃一些特别是豆浆黑豆这些食物。还有就是动物的内脏也少吃一些，因为它里面含有激素。如果吃这些食物，有可能会增加卵巢囊肿的。
治疗难易取决于病人年龄，症状是否恶变，囊肿的部位，体积，大小，生长速度，造成子宫附件的变形情况，是否保留生育功能及病人的主观愿望等因素而定。卵巢囊肿及时治疗，虽然小，但是也是要引起重视的。