自然流产后三周怀孕很可能会出现宫腔中的细菌感染，引起腹膜炎、败血症等情况。其次，还容易发生大量的失血，严重的话会导致患者休克。而且有可能引起胎儿的胎盘息肉和急性肾功能衰竭，因此在人流后最好及时前往那医院检查，确定是什么原因导致了自然流产，并且在自然流产后的近段时间内同房注意做好避孕措施，待身体恢复。
自然流产后一般流干净了，具体分析如下：
自然流产可以排出体外，但也有一些身体素质比较弱的女性，会出现不洁的情况。如果是自然流产，一般在自然流产一周后到医院做详细的检查，如果还没有完全排出，一定要在医生的指导下进行清宫，避免感染，影响身体健康。如果已经排出了，日常生活中要注意清洁卫生，做好避孕措施，多吃一些有营养的食物，不要食用辛辣刺激性的食物，同时要把内裤和毛巾暴露在阳光下，消毒。
自然流产通常不会影响下次怀孕。
建议在自然流产后细心调养身体即可，自然流产不会影响下一次怀孕，不必过于担心。自然流产后心态要保持良好，饮食要保证营养均衡，身体基本恢复后，可以适当运动，帮助身体机能恢复。若女性因本身体质差或者流产后没有好好调理，对下次怀孕可能有一定的影响，因此自然流产后的护理非常重要。自然流产后建议做一个全面的身体检查，让下次做备孕有良好的身体状态。
怀孕了自然流产后，要根据超声检查结果，看是否流产干净，采取对应的处理措施。
如若检查结果显示子宫腔内没有妊娠残留物，且无感染迹象，则无需处理。若仍然有残留物，需要及时通过清宫手术，将残留物清理出子宫腔外。
自然流产的原因有很多，如：先天胚胎发育异常、男性精子染色体异常、怀孕初期女性有吸烟喝酒等不良生活习惯等。要注意查找病因，积极治疗。
自然流产一般3-5天后阴道流血就会干净。
自然流产后的阴道流血量和来月经差不多。若流血量大、时间长，建议超过两个星期应及时就医，检查B超看宫腔内是否有残留，有没有不全流产，发现异常应及时做清宫手术。自然流产后要注意清洁卫生，若分泌物异常或有异味则可能是发生了感染的，应及时就医治疗消炎。自然流产后1个月内建议不要同房和盆浴。
自然流产后想怀孕检查项目有心电图、高频乳腺彩超、B超等。
如果自然流产后，还要想怀孕，建议及时到医院进行心电图、高频乳腺彩超、B超、妇科常规检查、白带常规+淋球菌+BV、染色体、优生四项、性激素水平、尿常规、肝功能、乙型肝炎血型等五项检查。女性在经过正常的生理期和精神状态后可以在医师的指导下进行怀孕。
需注意，男性也需要检查，比如精液常规、精子形态分析、地中海贫血筛查、梅毒螺旋体筛查、性激素水平、尿沉渣分析等。