霉菌性阴道炎在治疗上是比较困难。
因为霉菌性阴道炎复发的可能性比较高，所以在治疗上比较困难。但是如果谨遵医嘱使用药物，比如服用氟康唑进行抗感染，并且连续使用达克宁栓或者是克霉唑胶囊进行阴道给药两个疗程后，一般情况下霉菌性阴道炎都可以治愈。霉菌性阴道炎患者经过治疗，仍需要在每次月经干净后去医院复查妇科检查及阴道分泌物化验。
首先做好个人卫生管理，用5%的碳酸氢钠溶液清洗会阴，如果症状有明显改善，可以暂时不用进一步治疗，考虑生产之后再规范治疗。症状没有明显改善，阴道上药治疗。怀孕期间，由于激素水平波动，很容易出现阴道分泌物增加诱发，阴道炎的问题，如果已经明确诊断是霉菌性阴道炎。
轻度霉菌性阴道炎是比较容易治疗的。
一般的轻度霉菌性阴道炎，是会使用中药成分的洗液冲洗阴道，例如俏安婷湿痒洗液，阴痒康洗液，洁尔阴洗液，或者是西药的2%碳酸氢钠溶液，对阴道进行冲洗。又或者是使用阴道塞药物，比如盐酸特比萘芬阴道泡腾片、达克宁栓，以及外用达克宁霜、盐酸特比萘芬膏等。
建议患者平时注意外阴卫生，勤换洗内裤。
女性严重的阴道炎可以降低男性精子活动度从而降低怀孕的几率，女性有阴道炎时怀孕不符合优生的要求，要在怀孕前彻底治疗阴道炎，否则怀孕后容易导致早产，流产等，并且霉菌性阴道炎症状还容易加重，可以到医院做正规的冲洗上药结合理疗，彻底治疗阴道炎，然后采用检测排卵的方法帮助提高受孕几率。
一般来说，如果是霉菌性阴道炎，患者可能会出现外阴瘙痒、排尿痛、性交痛等症状。患者可以在医生指导下服用苦参、防风、土茯苓等中药，也可以在医生指导下使用复方黄松洗液，、制霉菌素栓剂、达克宁等药物进行治疗。对于霉菌性阴道炎的患者来说，要及时到正规的医院进行检查，并在医师的建议下使用药物进行处理。
此外，如果症状严重应该及时前往医院就诊治疗，以免耽误病情。
中医根治霉菌性阴道炎一般可采取阴道内用药、口服药物等方法。
在中医里，霉菌性阴道炎因湿热下注会增加阴道内的分泌物，从而造成细菌侵入，可以选用清热解毒、除湿、杀虫止痒等药物。可以阴道内用消糜栓、保妇康栓等药物。以及妇科千金片、妇炎康片、花红片等都是可以服用的。和西医的治疗方法差不多，都是在医生指导下按照疗程来服药，只不过这个周期比较慢，一般20多天。