巧克力囊肿严格来说，属于子宫内膜异位症的一种疾病类型，巧克力囊肿的问题而引发痛经、阴道流血等不良后果，子宫肌瘤巧克力囊肿在性交过程中还会出现阴道疼痛不适表现，子宫肌瘤发病后会出现月经过多、腹部压迫有肿块等情况，但是子宫肌瘤主要长在子宫体上面，并且随着生理年龄的增大会慢慢缩小。
子宫腺肌病和子宫肌瘤病变所在部位都是子宫肌层，但是形成病变的组织是完全不同的，子宫腺肌病是子宫内膜腺体及间质侵入子宫肌层形成的病变，而子宫肌瘤主要是由子宫平滑肌细胞增生。
巧克力囊肿是卵巢的，子宫肌瘤是子宫的。子宫肌瘤长在子宫体上，一般不会癌变，会随着闭经后子宫的萎缩而萎缩。巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一个表现，子宫内膜异位症在子宫体上称为子宫腺肌症或腺肌瘤，在卵巢上则称为巧克力囊肿。巧克力囊肿不会癌变。
子宫肌瘤又称子宫平滑肌瘤，长在子宫体上，一般不会癌变，会随着闭经后子宫的萎缩而萎缩。巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一个表现，子宫内膜异位症在子宫体上称为子宫腺肌症或腺肌瘤，在卵巢上则称为巧克力囊肿。巧克力囊肿不会癌变。
子宫肌瘤是一种子宫平滑肌的良性肿瘤，多表现为经期延长，月经量增多，甚至淋漓不尽。也有的伴有痛经的情况。巧克力囊肿则是卵巢的子宫内膜异位囊肿，多表现为痛经，是由于子宫内膜异位到卵巢却每次月经期间，卵巢内就会有流血，形成的。盆腔炎是盆腔的炎症，一般以两侧小腹的疼痛为主。
子宫肌瘤和卵巢巧克力囊肿的医治比较好的方法是通过药物医治，平时要饮食宜清淡，不能吃羊肉、虾蟹等发物，忌食辣椒、生葱生蒜等刺激性食物及饮料多吃蔬菜水果，平时多注意卫生。