卵巢巧克力囊肿的治疗费用一定程度上不同的病人病情不同，采用的治疗方法也不同，需要根据病人的具体情况来定。注意休息，调节情绪，保持良好的睡眠及饮食均衡，多进食新鲜水果蔬菜，劳逸结合，避免过度劳累、剧烈运动及紧张焦虑。
巧克力囊肿主要的临床表现是痛经，并且是进行性的。巧克力囊肿的治疗通常采用手术治疗，而最常用的是腹腔镜手术，费用都不同，但不同级别的医院，不同的区域费用会有所不同。当地咨询会更准确。
巧囊穿刺手术各个医院的收费标准不一样的，去正规公立医院比较安全的，收费也比较合理的。术后一个月内是禁止性生活的，大部分来说，禁止性生活主要是为了预防感染和预防子宫内膜异位症复发。一个月以后再去一家医院进行复查。大部分来说应该没有太大的问题。
由于这种疾病可以在盆腔的各个位置出现，所以手术的方式也是不尽相同的，正常如果是开腹手术，费用可能会比较低，大约在10000元左右。如果是使用宫腔镜手术，费用可能会在15000元左右。另外，术后常规应该使用药物，防止双侧卵巢巧克力囊肿复发，这种药物使用3-6个月，价格也是比较高的。
巧克力囊肿是由于子宫内膜异位症导致的，是因为一位的子宫内膜随着月经周期发生周期性出血，但是血液无法正常排出，所以局部会出现肿大和疼痛，囊肿内的血液因为长期不能排出呈巧克力状。巧克力囊肿一般选择的是腹腔镜手术切除，属于微创手术，术后身体恢复较快，费用2千-3千元。
卵巢巧克力囊肿治疗费用在2000元-4000元。巧克力囊肿就是子宫内膜异位症引起的，对于巧克力囊肿的治疗，包括药物治疗和手术治疗，除了进行治疗的手术以外，其他的治疗方式都是有可能会复发的。巧克力囊肿的治疗费用，根据所处地区消费水平不同，就诊医院的级别和性质不同。