大脑炎的严重程度决定了会不会留下后遗症，一些大脑炎患者可以痊愈，但也有部分患者付出了生命的代价，由于病毒侵入脑部的病毒数量较少或较弱，部分患者能痊愈，反之则可能留下后遗症，严重时危及生命。若损伤位于间脑，则有生命危险。如果出现脑炎的情况，可能会出现一些后遗症。出现癫痫、全身麻木、四肢无力等症状时，应及时就医，以免造成更严重的损伤。
脑炎主要会引起脑部剧烈性疼痛，还会引起高烧，如果不及时治疗对于大脑实质会产生损害，导致部分神经元细胞坏死，从而丧失部分神经元的功能。脑炎最严重的后遗症会影响后续脑部功能恢复，导致出现智力障碍，甚至出现精神行为异常。另外常见的后遗症会导致出现偏瘫，还有感觉障碍。现在对于脑部炎症引起的后遗症没有特殊治疗办法，只能平时多加进行康复锻炼训练。
病情严重者可出现后遗症。根据脑组织损伤部位不同，临床表现多种多样，如痴呆、言语障碍、哭笑无常、多汗，以及癫痫发作，即反复抽搐。还可出现智力障碍、肢体活动障碍，严重者出现植物生存状态，即植物人。
大脑产生炎症的后遗症，有以下几种：一、运动功能障碍。损伤部位对侧的肢体，发生运动能力下降，完全性瘫痪比较少见，多为肌肉、肌力减低，肌张力增高，僵硬为主。容易引起癫痫发作，被称为症状性癫痫，以部分性发作和复杂部分性发作最多见。
大脑炎后遗症是癫痫，癫痫病俗称羊角风，是由于脑细胞突然短暂过度放电而致的脑功能失调；病毒性脑炎后遗症的症状表现为运动、感觉、意识、植物神经、精神等不同障碍或可兼而有之，临床上以突然意识丧失，突然跌倒，四肢抽搐，口吐白沫或口中怪叫，醒后如常人。
脑膜炎一般是没有后遗症的，但后遗症一般伴有肢体功能障碍。现在只要没有肢体的活动障碍就不用担心。脑膜炎后遗症只要不伴有生殖器官疾病不会影响生育即使有肢体功能障碍存在或是智力存在问题，也没有遗传的可能，这一点可以放心。