通常来说，纤维胃镜检查会有一定的痛苦感。
在做纤维胃镜时会有一些疼痛，这个测试要求将透镜用一根管子放进肚子里，然后用软管里的纤维将它传送到外面。最大的疼痛是气管在经过喉咙后会对咽部造成刺|激，引起恶心、呕吐等症状，通常情况下咽部疼痛会减轻一些。此外，在做检查的过程中，还要往胃里灌入一些气体，这样可以观察到胃壁有没有损伤，会出现腹痛等情况。
做脑脊液的检测并不困难，需要做的就是做腰椎穿刺，做留取脑脊液。腰椎穿刺一般会先感觉到轻微的疼痛。到了后面，麻醉结束，病人就不会感到痛苦了，只要穿刺成功，就不会觉得疼了。一般情况下，只要保留10ml至20ml的脑积水即可。
如果脑脊液检查的检测结果存在异常，建议患者积极配合医生，在医生指导下进行对症治疗，不可以耽误治疗时间。
有无痛胃镜，一般情况下费用在200到900之间。
普通的胃镜一次在260元左右，无痛的胃镜一次就是在850元左右。胃镜检查是利用一条直径约一公分的黑色塑胶包裹导光纤维的细长管子，前端装有内视镜由嘴中伸入受检者的食道→胃→十二指肠，由光源器所发出之强光，经由导光纤维可使光转弯，让医师从另一端清楚地观察上消化道内各部位的健康状况。必要时，可由胃镜上的小洞伸入夹子做切片检查，费用在100左右。
肛镜检查有轻微的痛苦，主要是与检查水平和检查态度有关，另外，与肛门口的大小，肛门及直肠的发育程度都是有一定的关系的。掌握了技巧，动作温柔，进入的角度正确，配合良好，肛镜做好充分的润滑，疼痛不重，有轻微的胀痛感。如果肛门狭小，可能疼痛的情况就比较重。
做气管镜检查的时候，会有一定的不适感，但是，针对这种不舒服的感觉可以采取局部麻醉，使声门及会厌部的不舒适感减退，如果仍无法耐受时，也可采取全身麻醉后再做气管镜检查。
超声胃镜检查会有痛苦的，做超声胃镜通常状况下不是太痛苦，疼痛感是常人都可以忍受得住的，超声胃镜是先进的集超声波和内镜检查为一体的检查设备，可以仔细地查到身体不正常变化，是需要插管的。
