先天性癫痫强调查找病因，积极进行病因治疗，有些以往诊断为先天性癫痫的病人，在癫痫中心经过检查之后，发现了脑部的病变，找出了病变原因，可以进行相应的治疗。即使暂时找不到病因，原发性癫痫病人，也可以进行症状相应的治疗，服用有效抗癫痫药，以控制癫痫发作。
癫痫是多种原因引起脑部神经元群阵发性异常放电所致的发作性神经功能异常的一种疾病。治疗上首选药物控制，如果效果不佳可选择手术治疗。注意避免受到刺激，避免熬夜。按时服药，定期复查肝肾功。
先天性癫痫可根据患者的病情及病因进行相应的治疗，目前可采用药物治疗，给患者服用抗癫痫药物，可有效改善癫痫发作，如果癫痫是脑部疾病引起的可进行手术治疗。
先天性癫痫一般治疗的情况下可采用抗癫痫药与抗精神病联合治疗，如氯丙嗪和氟派丁醇等应急措施，唯有开颅手术治疗癫痫，药物治疗建议采用中药结合现在服用的西药治疗会有很好的疗效，中药采用以涤痰熄风，开窍定痫，活血化瘀、补益心肾、平肝泻火作用的汤药治疗，服用中药期间逐渐减掉西药，中药没有依赖性，副作用小。
原发性癫痫的初发年龄不定，多在幼儿期和少年期起病，以典型大发作或典型小发作为临床表现。对于原发性癫痫能不能问题的讨论，应转移到如何进行科学专业的治疗，在临床上，不管是什么类型的癫痫，在接受正规专业治疗的癫痫病人，有80%的都得到了有效的控制，最终达到效果。
先天性癫痫治疗难度比较大，所以要尽快的让孩子接受治疗，早期治疗才有可能成功的控制。在治疗小儿癫痫的过程中要注意以下几方面：要增加维生素b、c的摄入，维生素c缺乏，易使脑细胞的结构松弛或紧张。b族维生素能帮助蛋白质代谢，促进脑细胞兴奋、抑制机构更好的发挥作用。