可以通过表现出来的症状或者头部ct来鉴别诊断，比如病人出现了发热、头痛、呕吐、意识障碍、颈项强直等、昏迷、惊厥、出血疹。时候如果病人病因明确，就可以鉴别诊断属于颅内感染。
颅内感染的诊断标准：暴发性或急性发作；发烧，头痛，脑膜刺激征；脑脊液炎症性改变，主要是分叶结石粒细胞增多症；发热伴有不明原因呕吐、无精打采、抽搐、囟门饱胀和头痛等化脓性脑膜炎可疑症状的新生儿和婴儿，即使没有神经系统的客观指征，也应尽快穿腰穿，有时甚至需要反复脑脊液检查才能做出明确诊断。这种疾病的准确诊断应该基于病因学。
颅内感染脑脊液鉴别诊断是看是否有高热、头痛、颈项强直等颅内感染的症状和体征，是否脑脊液检查中白细胞WBC>0.01X109/L，以多核细胞增高为主，是否脑脊液细菌培养呈阳性结果，然后进行对症治疗。
儿颅内感染，一般会出现高热，四肢抽搐，甚至反应异常等情况。颅内感染也分成很多种，比如细菌感染，真菌感染，病毒感染等，具体的表现也不太一样。表现一般是和感染的范围有关系，以及受累及的脑液有一定的关系。
颅内感染的诊断，一般有着严格的诊断标准：(1)临床上有高热、头痛、颈项强直等颅内感染的症状和体征。(2)脑脊液检查中白细胞WBC>；0.01X109/L，以多核细胞增高为主。糖<；2.25mmol/L、氯化物<；120mmol/L、蛋白>；0.45g/L。(3)脑脊液细菌培养呈阳性结果。(4)有肯定的感染原因，如脑脊液漏等。凡具备第3条者可确定诊断，如脑脊液细菌培养阴性者需综合其余各条。
颅内感染是颅脑外伤、开放颅脑外伤、开颅手术等原因引起的一种神经外科疾病。如果发现颅内有炎症，就应该进行头颅影像学检查、头颅ct、头颅磁共振等检查。此外，需要进行腰椎穿刺，在颅压许可的前提下，可以进行腰椎穿刺，提取颅腔中的液体，进行生化检查。
此外，为了获得药物敏感性，需要进行脑脊液的细菌培养，需要进行腰椎穿刺。但如果是因为颅内感染导致了高颅压，就不允许进行腰椎穿刺，这很有可能会在脑室的前额、枕角上进行一次简单的手术，叫做脑室外引流术，将发炎的脑脊液排出体外。