脑炎的确诊需要行腰椎穿刺，测颅内压力，并取脑脊液化验，脑脊液化验的项目一般有脑脊液常规，三大染色，生化，病毒全套等。血象：白细胞1～2万，中性增高。脑脊液压力稍高，细胞计数一般在0.2×109以下，淋巴细胞占多数。糖及氯化物正常。
脑电图、脑脊液常规生化检查和头部CT及MRI检查。脑电图主要用于颅内器质性病变如癫痫、脑炎、脑血管疾病及颅内占位性病变等的检查。脑电图极易受各种因素干扰，应注意识别和排除。
排查脑炎要做脑脊液、头颅MRI等检查。
如果是脑炎，可以做腰椎穿刺的脑脊液检查。脑炎的病人，除了发烧、头疼等症状外，还可以通过头颅MRI来发现病变。如果是轻微的，没有明显的病变，可以通过头颅MRI来检测，确定没有病变，也就是说不能诊断出脑炎。如果需要进行腰椎穿刺，可以检测到患者的颅内压力和细胞数量。
脑炎患者可以通过抽血检查、脑积液抗原测定、电解质、肝肾功能等选择性进行检查。如果已经确诊脑膜炎的情况下，一定要积极配合医生的治疗，保持良好恶心态。根据不同类型的脑膜炎采取适当的治疗方法，遵医嘱使用合适的抗生素药物，注意体温变化避免着凉，多注意休息，日常建议食用黄瓜、葡萄、苹果、米饭、稀饭等食物，少食用辛辣刺激的食物，帮助病情的恢复。
对脑炎患者而言，有很多项目要进行检测，建议先改善相关实验室检测，如抽血化验血常规，生化系统、尿常规等。
此外，某些炎症标记物也需进一步检测，如降钙素原和c反应蛋白，再则可经腰椎穿刺而排出少量脑积液。进行了脑脊液常规，脑脊液生化及细菌培养，药物敏感试验。
如果发生脑炎，建议及时在医生指导下，采取抗生素进行治疗。