流脑疫苗有免费的，也有自费的。两者都是来预防流脑发生的。对于国家规定必须要注射的疫苗的情况下，基本都是免费的。免费的疫苗，那是由国家免费提供的，相对来讲价格便宜，效果比较理想，但是副反应可能会略大一点。自费的疫苗价格一般偏高，注射后出现副反应的可能性会小一点。
流脑疫苗自费免费区别是免费流脑疫苗是A群流脑疫苗，只用于预防A群脑膜炎球菌引起的流行性脑脊髓膜炎，而自费的流脑疫苗是A+C群流脑疫苗，这种疫苗可用于预防A群及C群脑膜炎球菌引起的流行性脑脊髓膜炎，自费疫苗预防的病毒种类更多一些。
自费的流脑疫苗是A加C群流脑疫苗，这种疫苗可用于预防A群及C群脑膜炎球菌引起的流行性脑脊髓膜炎。免费流脑疫苗是A群流脑疫苗，只用于预防A群脑膜炎球菌引起的流行性脑脊髓膜炎。
流脑疫苗打自费好，这种疫苗接种后对提高宝宝的免疫力有很好的效果。免费流脑疫苗是A群流脑疫苗，只用于预防A群脑膜炎球菌引起的流行性脑脊髓膜炎，而自费的流脑疫苗是A+C群流脑疫苗，这种疫苗可用于预防A群及C群脑膜炎球菌引起的流行性脑脊髓膜炎，自费疫苗预防的病毒种类多一些。
自费疫苗和免费疫苗的区别在于自费疫苗属于计划外疫苗，免费疫苗叫一类疫苗是监护人必须给孩子接种的。疫苗的疫苗费和接种费都需要支付。一类疫苗有些疾病没有覆盖的可以选二类疫苗如流感疫苗。
免费的属于计划免疫，是国家规定的免疫项目之一，可以无偿的免费给需要接种的小儿注射。可以优先考虑免费疫苗，对于收费疫苗，属于二类疫苗，管理一般也是比较严格的，有些属于进口疫苗，如果经济条件相对比较好，也可以考虑用进口疫苗，费用相对比较高。
