双侧基底节区腔隙性脑梗塞查找危险的因素，比如有没有高血压、糖尿病以及高脂血症，如果有这些基础病，应该积极的进行治疗，把血压、血糖以及血脂控制好。去除危险性的个人不良嗜好，忌烟酒。
只要不出血，用活血化瘀的药物，双侧基底节区腔隙性脑梗塞多见于脱髓鞘脑病，早发病都不严重，发病早期症状很轻且不明显，偶有头晕，头痛，视力异常或脑部不适以及轻度的局域性麻木，易复发和迟发神经再度损害，严重时可侵犯整个中枢导致神经功能损害发生痴呆症、痉挛性瘫痪而危机生命。
对于基底节区腔隙性脑梗塞的治疗，主要是完善相关检查。对于颅内血管的病变是否有动脉狭窄或者是动脉硬化，明确血管的性质，明确生化的检查，譬如血脂、血尿酸、血同型半胱氨酸等相关的危险因素。
没有临床症状，一般是无需治疗的，如果出现临床症状，一般是比较轻，比如头晕，头痛等，可以对症治疗一下，平时要注意休息，避免劳累，不要吃辛辣刺激性的食物，低盐低脂肪饮食，多吃水果蔬菜。
通常是由脑CT或MRI检查发，如果出现这一情况，不要紧张，但也要重视，首先要进行危险因素的控制，调整血压，血糖，血脂至达标范围，再次就是改变生活不良习惯，戒烟戒酒，清淡饮食，适当锻炼。