肾囊肿是良性的肿瘤，在5公分以下不需要特别治疗，定期检查就可以。在5~10公分之间可以做一个穿刺，10公分以上可以做一个手术，平时注意不要提重物，不吃刺激性的食物，不要剧烈运动的。
胎儿肾囊肿无需进行治疗。
因为胎儿肾囊肿的发病原因，与遗传因素或者先天发育异常有关。绝大多数的囊肿都属于良性病变，生长速度非常缓慢。单发的肾囊肿，对于胎儿的身体健康以及出生后的身体健康，都没有明显的不良影响，通常是不需要进行特殊治疗的。如果囊肿体积增大，可以进行手术治疗或穿刺抽液治疗。但如果对胎儿的身体较大时，应选择终止妊娠。
如果小于3cm的肾囊肿，可以定期的观察，不需要处理。超过3cm以后肾囊肿就需要处理，否则的话可能会导致破裂出血，感染，处理的方式主要是b超引导下的肾囊肿穿刺抽液手术以及腹腔镜下的去顶减压手术。
肾囊肿可单发或者多发，常见于男性，可压迫血管或者引发尿路梗阻出现病症，可有腰腹背部间歇性钝痛，继发感染可出现尿频尿急等症，B超，ct检查可诊断，手术治疗是有效办法。就诊肾脏外科检查治疗，适当补充高纤维、高维素食物，多吃新鲜蔬果，忌饮酒，少吃辛辣、油炸食品。
艾灸是不能治疗肾囊肿的，药物也不能治疗肾囊肿，肾囊肿的发病的原因是扩张的肾小管，这段扩张的肾小管，逐步独立，就形成一个囊肿，肾小管的壁有分泌功能，分泌液多就会囊肿增大，分泌液少囊肿增大的不明显。