治疗的方法有：GPH基因递进增强疗法，针对病毒有极强极复杂生物基因链因此生殖感染易反复发作不容易痊愈的特点从基因分子生物学角度破坏病毒的基因生物链达到治疗的目的。局部应用治疗，经尿道插管，注入抗真菌类等的一些的药物，进行冲洗，可有效治疗。
对因治疗，尽可能去除各种诱发因素及积极治疗原发病，加强营养，增强机体抵抗力，补充大剂量维生素。抗菌药物，消灭致病菌，这也是治疗尿路感染关键的一环，对急性起病者，抗菌药物治疗最为重要。
抗生素与化学药物联合应用，疗效较好，全身治疗应注意休息，补充足够液体。消除易感因素，如避免长期使用抗生素、免疫抑制药、解除尿路梗阻，控制糖尿病等使机体抵抗力下降的疾病，尽量减少导尿及长期保留尿管等。
常用的治法有：艾灸治疗，可选取命门、三阴交、肾俞、膀胱俞、阴陵泉等穴，用泻法适用于湿热下注者。消除易感因素疗法，如避免长期使用抗生素、免疫抑制药、解除尿路梗阻，控制糖尿病等使机体抵抗力下降的疾病，尽量减少导尿及长期保留尿管等。
中医治疗，中医常采用益气，补肾，清热利湿并重的原则，邪正兼顾，特别是对于湿热下注型患者疗效更为明显。对因治疗，尽可能去除各种诱发因素及积极治疗原发病，加强营养，增强机体抵抗力，补充大剂量维生素。
中医治疗，中医常采用益气，清热利湿并重的原则，邪正兼顾，特别是对于湿热下注型患者疗效更为明显。抗生素治疗，抗菌疗法为首选方法，首先按常见病原菌给予敏感抗生素。