病因治疗，需要查明病因针对性治疗，原因可能是炎症感染，或结核杆菌感染，或者结石的原因造成的，也有可能是输尿管发育畸形。如果是炎症感染造成的，需要应用抗生素控制炎症。结石需要采取体外碎石，也可以采取药物溶石的方法治疗。如果发育畸形造成的需要采取手术治疗；肾切除术，肾积水严重，剩余的肾实质过少，或伴有严重感染即肾积脓时，如对侧肾功能良好，可切除病肾。
治疗难度根据病情而定，可以选择保守治疗，比较适合肾积水较轻，病情进展缓慢，肾功能达到平衡和稳定状态的患者。当患者肾积水逐渐加重，临床症状明显，肾功能持续下降，梗阻原因明确，并发症多时，应及时进行外科治疗。
治疗肾积水越早越好，存在肾盂输尿管连接部异常的，则可采用整形手术尽早矫正，那么病情就能够得到明显的改善，而对于病情已经比较严重的，甚至以及影响到正常肾功能的，那么应该酌情选择积水肾切除术来达到治肾积水的目的。
肾积水可以出现因为肾结石引起的腰痛、肉眼血尿等临床症状。前列腺增生引起的积水，会有尿频、尿急、会阴部潮湿等症状。如果肾积水特别严重，引起肾功能衰竭，会有肾功能衰竭的相关表现，比如出现明显的四肢的浮肿。
肾积水的治疗方法有手术切除，取石治疗等方法。肾积水是由于泌尿系统的梗阻导致肾盂与肾盏扩张。其常见的症状有腹部包块和腰部胀感，伴有恶心、呕吐、腹胀、尿少等。近期不要吃过于硬化的食物，可以吃些富含维生素类的蔬菜水果。
由于尿路结石引起的肾积水，可以行体外震波碎石或者内镜下碎石取石治疗。病情较重，不允许做大手术，或者梗阻暂时不能去除，可以在超声引导下，经皮肾穿刺造瘘，将尿液直接引流进行治疗。输尿管炎性狭窄，或者晚期肿瘤压迫，引起的肾积水，可以经膀胱镜放置双j管，行内引流治疗。