主要是大肠杆菌的感染，另外还有变形杆菌、葡萄球菌、粪链球菌及引起急性肾盂肾炎大多起病急且病情重。应根据病人症状体征的严重程度决定治疗方案。在采尿标本作细菌定量培养及药敏报告获得之前，要凭医生的经验决定治疗方案。鉴于肾盂肾炎多由革兰阴性菌引起，故一般首选革兰阴性杆菌有效的抗生素，但应兼顾治疗革兰阳性菌感染。
急性肾盂肾炎问题不大通过治疗可以治好，一个星期就差不多了。可以在医生指导下结合临床症状对症治疗，可以用敏感的抗生素进行治疗。多喝水促进细菌从尿中排出。
肾盂肾炎常伴有发热、显著的尿路刺激症状，或伴有血尿时应多休息，症状明显减轻后即可起床活动。一般休息7～10天，症状完全消失后可恢复工作。发热、全身症状明显者，高热、消化道症状明显者可静脉补液。每天饮水量应充分，多饮水，多排尿，使尿路冲洗，促使细菌及炎性分泌物的排出，并降低肾髓质及乳头部的高渗性，不利于细菌的生长繁殖。应根据症状体征的严重程度决定治疗方案。
一般来说，孕妇急性肾盂肾炎可采取以下手段治疗：
及时抗感染治疗是治疗患有急性肾盂肾炎孕妇的主要方式，头孢三代等抗生素或头孢他定或氨苄西林等半合成青霉素，对胎儿的影响比较小且有助于改善症状，孕妇可在医生的指导下进行服用；此外，建议孕妇在日常生活中，要定期到医院做产前检查，还要注意饮食健康，多吃新鲜的蔬菜和水果，保证营养均衡，多注意休息，避免劳累，保持心态平和，有利于身体健康。
急性肾盂肾炎做检查费用1千-3千元左右。医院的所在位置不同，收费的标准情况就不一样，检查的器材不同，导致检查的费用就有不一样的情况出现。患者的身体条件不同，做的检查最后的价格有很大的差异。
治疗急性肾盂肾炎1万-2万元左右。不同的病患，出现的病症不同，就诊的医院不一样，那么治疗的医生就不同，医生给出的治疗方案也不一样，所以导致患者的在进行治疗以后的一些费用上就有很大的不同。