小儿厌食的原因是与消化道疾病、微量元素缺乏、喂养不当等有关。通常的宝宝厌食症是指长期的食欲减退或消失、以食量减少为主要症状，是一种慢性消化功能紊乱综合征，是儿科常见病。
可能是体内缺乏微量元素导致的。可以到正规医院进行微量元素的测定，根据检查结果对症治疗。平时多正确的引导孩子，在饮食上适当调整，多吃一些维生素含量较高的蔬菜水果，例如青菜、白菜、胡萝卜、西兰花等。
儿童挑食是由于微量元素缺乏，饮食结构不合理等原因导致的。缺锌导致味蕾不敏感，补锌可以提高身体抵抗力，可以使口腔唾液中味觉素含锌量增高，恢复味蕾的敏感度，从而增进食欲。提高身体免疫力减少感冒。
针对儿童厌食不能强迫进食，以免造成宝宝对食物产生抵抗情绪并加重身体的不适。要做到平时鼓励宝宝多饮水、酸奶、益生菌等有助于消化食物。多参加户外活动，活动可刺激胃肠道的蠕动，加速消化。不吃生冷食物，伤害宝宝的消化系统。
宝宝厌食的原因主要是脾虚或者缺乏微量元素。因局部或全身性疾病影响消化功能，使胃肠平滑肌张力低下，消化液分泌减少，酶的活性降低；另一种是中枢神经系统受人体内外环境刺激的影响，使对消化功能调节失去平衡。