手术治疗：手术治疗在小儿脑炎后遗症患儿的临床治疗中占有重要的地位。在各种非手术治疗无效时,手术就成为重要手段。心理治疗：受病情影响，严重影响病情治疗，所以心理治疗很重要。
如果是大脑缺氧者，可以采用普通的吸氧，条件可以的情况下使用高压氧治疗，这样能有效的改善大脑血液缺氧供应，对于恢复是有帮助的，同时还以进行中医治疗的方法，如推拿、按摩等，这能起到辅助的作用。
帮助患者进行早期的康复和功能的锻炼，脑炎后遗症的护理可以帮助患者尽快最大限度的恢复生理功能。脑外伤后遗症的护理要配合患者做好日常的基本生活，锻炼患者的自主生活能力。
首先要做个24小时动态脑电图，还要做颅脑影像检查，还有脑CT或者核磁共振，还做血糖、电解质的检查，并应结合患者的具体情况选择相应的检查，其他的检查就得，根据病人的情况来决定，并根据临床症状来判断是否会在发病。
脑炎后遗症患者千万要注意不要过饥或过饱，也不要暴饮暴食，过度饥饿使血糖水平降低，而过饱后血糖水平会快速升高，这些都会诱发脑炎后遗症严重化。再结合上中药清热解毒，效果会更显著。
通常具体要看患者的情况，如果轻微的患者则药物配合康复训练治疗，慢慢就会可能恢复，但要是严重的患者，则要去正规医院进行手术治疗，在配合康复训练，但需要一定的时间慢慢达到康复的目的。