微波消融术的副作用包括轻度的疼痛、消融后综合征及无症状性胸腔积液等。消融后综合征常常表现为低热和全身不适，其持续时间与微波消融引起组织坏死的体积以及的全身状况有关，副作用都是自限性的，不需要治疗，基本在三天左右。
微波消融术的副作用包括轻度的疼痛、消融后综合征及无症状性胸腔积液等。消融后综合征常常表现为低热和全身不适，其持续时间与微波消融引起组织坏死的体积以及患者的全身状况有关，一般持续3天左右。这些副作用往往是自限性的，通常无须治疗。严重的并发症包括胆管狭窄、出血、肝脓肿、皮肤烫伤、肿瘤种植等，但是发生率较低。
微波消融术是一种物理热消融的方法，能够通过一定的时间和频率，使电机产生100度以上的高温，当肿瘤到达温度时蛋白质就会变性，从而起到杀死肿瘤细胞的目的。微波消融术的方法，一般最常见的就是运用于抑制肿瘤的生长，抑制癌症细胞的病变。
这类甲状腺手术的安全性高，全程高清在超声引导下进行手术，超声精确锁定甲状腺病变组织，然后针探头发热消融，能最大程度降低正常甲状腺组织和颈部周围神经血管损伤的风险，保留现存甲状腺的功能。
微波消融术和射频消融术都是国内治疗肝癌的先进的手术方式，治疗效果肯定相差不大。微波消融术是通过电极发出微波，通过电压改变瘤体内水分子的极性，形成交变电场产热而起到杀灭作用。射频消融的原理是通过高压电流，在高压电流作用下肿瘤体内极性分子会高速运转产生热量，达到杀死肿瘤细胞的作用。
