菌子中毒的症状根据毒素类型的不同而有所不同，胃肠炎型毒素中毒，一般进食后10分钟-2小时会出现乏力、恶心、呕吐、腹痛、水样腹泻等症状，腹泻严重时还可能出现脱水症状，神经精神性毒素，除了会出现胃肠炎的症状外，还会出现精神兴奋、精神错乱、头昏、恶心、呕吐、烦躁、幻觉、幻听等症状。
菌子中毒前的症状是胃肠道反应，以及麻木等症状，一旦出现剧烈呕吐或麻木等症状则要及时到医院就诊，蜡样芽孢杆菌会引起食物中毒，中毒者症状为腹痛、呕吐、腹泻，受污染的食物不会出现明显变质，米饭等淀粉类食物最容易受污染。
吃菌子中毒的症状有剧烈恶心、呕吐、腹痛、腹泻、烦躁、幻视、肢体无力、急性肾功能衰竭、甚至肝坏死、休克、死亡。在平时的生活中要注意不要购买自己不熟悉的菌子，尤其是颜色鲜艳的野生菌。食用菌子的时候，不要饮酒。
吃韭菜轻微中毒症状可出现头痛头晕、恶心呕吐、腹痛腹泻、胃肠不适等症状，严重时可出现胸闷、视力模糊、瞳孔缩小等症状。平时多注意饮食卫生，选择膳食纤维含量高的食物，促进肠胃蠕动，养成良好的生活习惯。
氟中毒多见于饮用被氟污染的水源或者燃烧高氟煤等人群。可引起氟斑牙或者氟骨症等疾病，氟斑牙可表现为牙釉质光泽改变，出现斑点斑块，釉面出现黄或者深褐色等，牙釉质出现凹痕或者剥脱。