一般乙肝抗病毒治疗需要长期吃药，因为治疗使用的不是特效治疗药物，而且无法预知具体多长时间可以达到停药的标准，只能是建议长期服药，治疗期间观察疗效，根据疗效判断病情。
目前乙肝有很多的治疗方式，但是没有一种可以完全治好。乙肝抗病毒的治疗，如果是用核苷类的西药，一个疗程时间一般是两年以上。如果是用中药或中成药抗病毒治疗，至少也得半年左右。
用乙肝疫苗后多长时间能产生阳性的乙肝表面抗体，普遍认为，有些人在第一针后便能产生抗体，但也有可能要用2针或3针乙肝疫苗，才能产生抗体。第二，如果没有注射乙肝疫苗的话，那么即使是已经接种了四次也不会出现乙型肝炎表面抗原阴性的现象，因为乙肝病毒本身并不存在免疫应答能力。此外，即使3次乙肝疫苗也不能产生乙肝抗体，因此，推荐3次乙肝疫苗后服用，再过一至三个月做乙肝两对半，对乙肝表面抗体阳性与否进行评价。
乙肝治疗需要6个月-12个月时间，乙肝的治疗方式就是进行抗病毒治疗，可以选择传统的治疗方案，包括普通治疗以及长效治疗，必要的时候，可以采取中医中药的方法来进行治疗，会达到比较好的治疗效果。
乙肝目前没有特效的药物和治疗方法，最有效的抗病毒治疗转阴率50%左右。所以用药也不一定能转阴，这与个体的免疫系统功能有关。另外，肝功能正常的情况下是不主张用药的，一是此阶段抗病毒治疗的效果不理想，二是盲目的用药反而增加肝脏的负担，不利于病情。如果肝功能正常，可以暂时不用药，平时注意劳逸结合，饮食清淡均衡，不喝酒，定期复查动态了解肝脏变化情况。
肝功能持久性不正常，也可能在3-5年时间就可以进展到肝脏肿瘤。乙肝病毒携带者，最关键的是需要保持肝脏功能的正常，很多由乙肝所导致的肝癌，主要是反复的肝脏损伤而出现肝细胞的癌变。