诊断甲型肝炎时，应先查病毒学指标。
一般是建议进行抗甲肝病毒IGM试验，起病约1周后血清可测得，它的发生符合临床症状和生化指标异常发生的时机。第2周达峰值，一般持续八周，少数病人可达半年或更长时间，但也有个别病人在发病初期为阴性，2~3周后才可检测到阳性，因此，临床疑为甲型肝炎病毒IGM阴性者应反复检查1~2次，避免漏诊，目前，他对甲型肝炎具有高度特异性的早期诊断标志，并有简单快捷等优点。
还可以进行抗甲肝病毒IGA试验，IGA型抗体也称分泌型抗体，主要分布在泪眼、唾液、尿液、胃液、组织中，鼻腔分泌物，胃液内IGA可向粪便排泄，甲型肝炎病人粪便提取液可测定，抗HAV-IgA是甲型肝炎辅助诊断方法之一。
有无误食毒物或用药史。急性甲型肝炎并须与EBV感染相鉴别，后者发热时间较长，常有咽峡炎、淋巴结肿大、异型淋巴细胞增多、噬异凝集试验阳性、抗-HAVIgM阳性等。在诊断时，还应考虑到全身感染性疾病如伤寒、败血症等出现的肝大、黄疸、肝功异常。
甲肝做甲肝抗体检查确诊。
甲肝igm抗体呈阳性，提示有急性甲肝感染，一旦确诊为甲肝，需要进行消化道隔离，同时进行保肝护肝对症治疗，急性肝炎的病程一般为25天，25天左右，大多数患者都会完全康复，而且会生成终身免疫抗体，不会再次患上甲肝。同时还可以通过接种甲肝疫苗产生抗体来防止甲肝的感染。甲肝患者平时要保持良好的生活习惯，不能食用不洁的水，食品，海鲜等。
甲肝必须通过血常规、尿常规、肝功检查、病原学检查、影像学检查、肝组织病理检查等确诊。甲肝是肝炎中传染比较急性的一种，所以在临床上需要及时明确病理损伤，及早用药治疗和前期的急性控制。
乙型肝炎，需要2-3周左右的时间才可以排除。
甲型肝炎的窗口期一般为2-3个星期，即从感染了甲型肝炎病毒到可以检出甲型肝炎抗体igm。乙型肝炎的窗口期为6星期，如果感染了乙肝，人体可以检出乙肝表面抗体，在此期间可以进行检查。乙肝是由消化道的粪便传染，乙肝是由血液、母婴传染的。患者平时要定复查，并且还需要在医生的指导下进行治疗。