新生儿接种乙肝疫苗的时间为出生后24小时内接种第一次，然后分别在1月龄、6月龄的时候再次接种，共3次。乙肝疫苗接种同样有一定的禁忌证，如携带乙肝病毒、对疫苗的成分过敏、患有神经系统疾病、重度营养不良、先天性免疫功能缺陷、正在使用免疫抑制剂等人群禁止接种乙肝疫苗。
新生儿接种乙肝疫苗是按出生后24小时内。新生儿体重低于2250克，满月后就持预防接种卡去接种。早点接种疫苗是为了新生儿不会感染结核和乙肝，不会有什么事情。在出生后一个月内就为婴儿接种疫苗，不要超过一个月，之后的要打的疫苗就是国家免疫程序里的乙肝、百白破、麻风、麻腮风、流脑之类的。
为了有效的预防乙肝病毒的传染，乙肝疫苗的免疫接种纳入基础的接种范围以内，孩子出生以后，按照0-1-6月份的时间进行正规的疫苗接种。新生儿的母亲是乙肝病毒感染者，尤其是大三阳的患者，孩子出生以后，除了正规进行疫苗的接种，还需要使用乙肝高效价免疫球蛋白，一般在出生后24小时内尽早使用，然后在半个月以及一个月的时候，分别再次使用，可以有效的预防乙肝病毒的垂直传染的发生。
乙肝疫苗第2针一般在满月后接种，但是如果孩子有异常情况，比如发热，黄疸，流涕，咳嗽，腹泻等症状时，是不能接种疫苗的，因为会使病情加重，对孩子的身体健康造成损害，此时应该延期，积极治疗疾病，直到病情完全恢复时进行接种。
婴儿乙肝疫苗接种3次，第1针于生后24小时开始。
第2针是在生后第1个月或1个半月后打，不宜推迟过久，否则，很可能造成接种不成功。如果孩子是第一次免疫，应该间隔三个月以后再进行第二次或第三次的接种，这样才不会出现不良反应。第3针于第6或6个半月后注入。
注射乙肝疫苗3次后约两个月，需到医院复查婴儿体内有无乙肝抗体阳性，以确定接种成功与否。
由于乙肝抗体保留在机体的时间因人而异，一般是10年左右，成年时可选择打乙肝加强针，增加防御力，还可选择注重保护，增强身体素质，以防止乙肝感染发生概率。
打乙肝疫苗需要去医院抽血检查乙肝五项，如果没有抗体，应及时注射疫苗的，如果有抗体，这就不用注射的，定期检查，注意休息，注意多喝水，不要吃辛辣刺激的食物，多吃瓜果蔬菜。适当锻炼身体。