乙肝小三阳抗病毒治疗主要目的是抑制病毒复制，减少传染性，改善肝功能，提高生活质量，减少或延缓肝硬化、肝衰竭、肝癌的发生，符合适应证者应尽量抗病毒治疗。其停药指征包括：肝功正常；病毒定量阴性；HBeAg出现血清学转换，出现HBeAb，这称为完全应答，抗病毒治疗病例中不超过30％。临床治疗时间目前倾向于长期用药，出现耐药后及时更换抗病毒药物。
服用恩替卡韦抗病毒治疗已经3年，需要进行检查，检查提示肝功能正常、一直保持阴性，按照慢性乙肝防治指南的标准，可以考虑停药，停药以后，仍需定期3到6个月复查肝功能及HBVDNA，期间有不适随时就诊。
要吃抗病毒的药物。具体都要吃多久，主要是根据自身的情况来看，有的人需要常年服药，但是也有的人需要吃一两年的时间就可以了，所以必须要结合自身的情况来看，平时注意劳逸结合，饮食清淡均衡，不喝酒，定期复查动态了解肝脏变化情况。
乙肝小三阳的病人，如果乙肝病毒没有变异的话，通常低于10的4次方。如果肝功能反复异常，病毒量持续升高，肝功能反复异常达到半年时间，可以进行抗病毒治疗。如果肝功能正常，病毒量低，腹部彩超正常，无需治疗，只需定期复查腹部彩超、乙肝DNA、乙肝五项、肝功能、甲胎蛋白，需注意休息，勿熬夜、劳累、饮酒等。
乙肝小三阳，肝功能正常，如果腹部彩超也是正常的，没有肝硬化或者肝纤维化，是不需要治疗，需要进行定期地复查，充分地休息好，不能熬夜、不能喝酒、不能过度的劳累，如果腹部彩超提示肝脏已经有肝纤维化或者肝硬化，那么，则需要积极地规范得抗乙肝病毒治疗。
乙肝小三阳需要进行抗病毒治疗。定期到专科医院检查确定病情是否稳定，病毒复制状况、肝脏受损的程度，便于专科医生及时制定治疗方案。乙肝通过血液与体液传播，具有慢性携带状态。因其可能通过性生活传播，国际上将其列入性传播疾病。