超级病毒感染后，在不同人群产生不同的临床表现，而且病情轻重不一，绝大多数健康感染者可无任何临床症状。新生儿感染后常产生致命性的先天性巨细胞病毒感染综合症，患儿出现黄疸、肝脾肿大、多系统损害、小头畸形、运动障碍和大脑钙化等。青年人原发巨细胞病毒感染后，可出现感染性单核细胞增多症，临床表现以发热，淋巴结病变和外周血淋巴细胞计数相对增多为特征，常有轻度肝功能异常，但无黄疸。
丙肝的初期症状表现在流感；食欲不振，吃东西不香；恶心、呕吐；出现黄疸；少部分病人出现肾衰竭。丙型肝炎的临床症状跟一般肝炎的临床表现基本相同，有急性和慢性两种，以慢性最多见。慢性丙肝可能在20年间没有任何明显的症状，感觉身体没什么力气、没劲，即便经过了充分休息，这种疲倦感也仍会不间断。
气郁主要症状表现为烦躁易怒，胸胁胀满、女性乳房胀痛，小腹胀痛，月经不调等临床表现。出现气郁的，一般多由于情志不遂，或者是生活工作压力比较大造成的。治疗上主要是口服一些疏肝理气的药物进行治疗。平时保持一种乐观积极的生活态度，少生气。
临床症状及肝功能损害较重。一般起病急，黄疸多见。半数有发热，伴有乏力、恶心、呕吐、肝区痛。约1/3有关节痛。常见胆汁淤积状，如皮肤瘙痒、大便色变浅较甲型肝炎明显。多数肝肿大，脾肿大较少见。
肛瘘的症状是会排脓，脓汁粘稠，黄色、味臭；瘘管日久的排脓相对较少，或时有时无，稀淡如水；若脓量增加，则表示新瘘管生成瘘管有时会暂时封闭，不排脓液，从而出现局部肿痛，体温上升。
